RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 COX20Q5RI15 118 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 METRNLQ641Q3 311 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 LRTM2Q8N967 370 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM178AQ8NBL3 297 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 CT55Q8WUE5 264 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 JMJD8Q96S16 334 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 TTC3P53804 2025 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 AKAP12Q02952 1782 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 DHRS3O75911 302 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 C18orf15Q96N68 181 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 H3BMG7 143 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 REG1BP48304 166 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 CRIM1Q9NZV1 1036 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 TMEM213A2RRL7 107 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 M0R3E3 92 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 PAX1P15863 534 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 TAL2Q16559 108 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF683Q8IZ20 524 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM86AQ8N2M4 240 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM252Q8N6L7 170 aa4.81□□□□□ -1.64
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