RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429574.1

LIN28AP1-201, Transcript of LIN28A pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene LIN28AP1, Length 405 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AP1-201ENST00000429574 RAB9AP51151 201 aa14.72□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF616Q08AN1 781 aa14.72□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.72□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 HES5Q5TA89 166 aa14.72□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa14.72□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF491Q8N8L2 437 aa14.72□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 RNF5Q99942 180 aa14.72□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.72□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 TRDCB7Z8K6 153 aa14.71□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 PPIFP30405 207 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 SERPINB10P48595 397 aa14.71□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 CBX3Q13185 183 aa14.71□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.71□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.71□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 RAB3CQ96E17 227 aa14.71□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 CLCC1Q96S66 551 aa14.71□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 B9D2Q9BPU9 175 aa14.71□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 KLK15Q9H2R5 256 aa14.71□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LIN28AP1-201ENST00000429574 H0YJW9 148 aa14.7□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 LY86O95711 162 aa14.7□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 IGLV1-40P01703 118 aa14.7□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 TFAP2AP05549 437 aa14.7□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 TALDO1P37837 337 aa14.7□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.7□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 GFI1Q99684 422 aa14.7□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 GNB4Q9HAV0 340 aa14.7□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 A0A075B6Q4 140 aa14.69□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.69□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 INSL3P51460 131 aa14.69□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 TMEM50BP56557 158 aa14.69□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 CX3CL1P78423 397 aa14.69□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 ACTBL2Q562R1 376 aa14.69□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.69□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.69□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.69□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.69□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.69□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 RDH8Q9NYR8 311 aa14.69□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.68□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 BET1O15155 118 aa14.68□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 RUNX1Q01196 453 aa14.68□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 ARFRP1Q13795 201 aa14.68□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 PDPNQ86YL7 162 aa14.68□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.68□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 PTX4Q96A99 478 aa14.68□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 PRR25Q96S07 402 aa14.68□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 AGMATQ9BSE5 352 aa14.68□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 CENPOQ9BU64 300 aa14.68□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.68□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.67□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 M0R1X1 148 aa14.67□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 OVOL1O14753 267 aa14.67□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 FABP7O15540 132 aa14.67□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 CNIH1O95406 144 aa14.67□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 RAB3BP20337 219 aa14.67□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 FHL3Q13643 280 aa14.67□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.67□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.67□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 GINS4Q9BRT9 223 aa14.67□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 LINC01619G3V211 115 aa14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 I3L521 148 aa14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 FCN1O00602 326 aa14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 SPDEFO95238 335 aa14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 GNB1P62873 340 aa14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 PSG5Q15238 335 aa14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 PLAC9Q5JTB6 97 aa14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF429Q86V71 674 aa14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 RAB26Q9ULW5 256 aa14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 IFITM5A6NNB3 132 aa14.65□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 SAP30O75446 220 aa14.65□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 CA2P00918 260 aa14.65□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 OR8U9P0C7N5 309 aa14.65□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 GNB3P16520 340 aa14.65□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 TPPP2P59282 170 aa14.65□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 ARL6IP1Q15041 203 aa14.65□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 AKIRIN2Q53H80 203 aa14.65□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.65□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 LFNGQ8NES3 379 aa14.65□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.65□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.65□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 DCUN1D4Q92564 292 aa14.65□□□□□ -0.06
LIN28AP1-201ENST00000429574 MS4A10Q96PG2 267 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms