RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 AKIRIN2Q53H80 203 aa16.25■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 OR5B12Q96R08 314 aa16.25■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 TOLLIPQ9H0E2 274 aa16.25■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 Q9N2K0 584 aa16.25■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 TPSG1Q9NRR2 321 aa16.25■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 OR1A1Q9P1Q5 309 aa16.25■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 TPRKBQ9Y3C4 175 aa16.25■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 CEACAM6P40199 344 aa16.24■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM50BP56557 158 aa16.24■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 DCUN1D4Q92564 292 aa16.24■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM203Q969S6 136 aa16.24■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01619G3V211 115 aa16.23■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 H7C2Y5 167 aa16.23■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 HSPA12AO43301 675 aa16.23■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 PROP1O75360 226 aa16.23■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 CPEP16870 476 aa16.23■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 P2RY14Q15391 338 aa16.23■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 RAB11BQ15907 218 aa16.23■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF562Q6V9R5 426 aa16.23■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa16.23■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 FCN1O00602 326 aa16.22■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 SCTP09683 121 aa16.22■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 RPS25P62851 125 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 PSG5Q15238 335 aa16.22■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R27Q86WC6 154 aa16.22■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 PDPNQ86YL7 162 aa16.22■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 OR56B1Q8NGI3 324 aa16.22■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa16.22■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 PECRQ9BY49 303 aa16.22■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 SLA2Q9H6Q3 261 aa16.22■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 LDLRAD4O15165 306 aa16.21■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 RGS10O43665 173 aa16.21■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 VEGFCP49767 419 aa16.21■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 PSMD7P51665 324 aa16.21■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 AQP4P55087 323 aa16.21■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 ACTBL2Q562R1 376 aa16.21■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF221Q9UK13 617 aa16.21■□□□□ 0.19
LIMS1-208ENST00000428064 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 DIRAS3O95661 229 aa16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1-16P04430 117 aa16.2■□□□□ 0.18
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LIMS1-208ENST00000428064 HSMCR30P0CW71 290 aa16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 CALRP27797 417 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 CD40LGP29965 261 aa16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINB10P48595 397 aa16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 ACSM6Q6P461 480 aa16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS48Q7RTY5 328 aa16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF383Q8NA42 475 aa16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 OR4A4PQ8NGN8 299 aa16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD5Q8WTS1 349 aa16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 FAM3DQ96BQ1 224 aa16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 ACOT13Q9NPJ3 140 aa16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 GAB2Q9UQC2 676 aa16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 A3GALT2U3KPV4 340 aa16.2■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087WW49 117 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 TRDCB7Z8K6 153 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 SAP30O75446 220 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 LY86O95711 162 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 CA2P00918 260 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 APOA2P02652 100 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 OR8U9P0C7N5 309 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 SLURP1P55000 103 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 FABP5Q01469 135 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 PLAC9Q5JTB6 97 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 RHOVQ96L33 236 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 RDH8Q9NYR8 311 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 V9GY05 133 aa16.19■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 ERICH4A6NGS2 130 aa16.18■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 H3BUA1 57 aa16.18■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 CRHBPP24387 322 aa16.18■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 C2orf76Q3KRA6 126 aa16.18■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 LFNGQ8NES3 379 aa16.18■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16.18■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 CASTOR1Q8WTX7 329 aa16.18■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 NRG4Q8WWG1 115 aa16.18■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 ARPC1AQ92747 370 aa16.18■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 MGLLQ99685 303 aa16.18■□□□□ 0.18
LIMS1-208ENST00000428064 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
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