RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 PRR19A6NJB7 356 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM74A7A6NL05 159 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 ZIC3O60481 467 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 EFEMP2O95967 443 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 OR10J1P30954 320 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 IMMP1LQ96LU5 166 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 RBKSQ9H477 322 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 SMDT1Q9H4I9 107 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 ORM1P02763 201 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 IFNL4K9M1U5 179 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 MPDU1O75352 247 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 PTGDSP41222 190 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 H2BFSP57053 126 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 UNC119Q13432 240 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 NRIP2Q9BQI9 281 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 GP6Q9HCN6 339 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 WASHC3Q9Y3C0 194 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 GFRA3O60609 400 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 HYPMO75409 117 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 NCMAPQ5T1S8 102 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 STARD4Q96DR4 205 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD36A6QL64 1941 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 CEACAM18A8MTB9 384 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 GDF9O60383 454 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 C1QL1O75973 258 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 RPL30P62888 115 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 RPL8P62917 257 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 PAXXQ9BUH6 204 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 HIGD1AQ9Y241 93 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 HKR1P10072 659 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 HOXA6P31267 233 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 LDLRAD3Q86YD5 345 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC75AQ8NAA5 344 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF115Q9Y4L5 304 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 TUSC1Q2TAM9 212 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 CLEC2AQ6UVW9 174 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 OR5P3Q8WZ94 311 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 SDK2Q58EX2 2172 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2T8A6NH00 312 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM87AP0C7U9 286 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 GLIPR1P48060 266 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM183BQ1AE95 376 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 HLA-DRB5Q30154 266 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 OR1L6Q8NGR2 347 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 RIGQ13278 110 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM216AQ8WUB2 273 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 AQP10Q96PS8 301 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 SOSTQ9BQB4 213 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC2A8Q9NY64 477 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 C16orf82Q7Z2V1 217 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 MMD2Q8IY49 270 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 OR52M1Q8NGK5 317 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM204Q9BSN7 226 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 FUT9Q9Y231 359 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 RTTNQ86VV8 2226 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 CCKARP32238 428 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 JPT1Q9UK76 154 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNMB1Q16558 191 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM90A26D6RGX4 464 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 J3KRW8 73 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 F12P00748 615 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 FADS6Q8N9I5 356 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAM11O75078 769 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM140Q9NV12 185 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0G2JMM0 328 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PPB8 328 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PRS3 328 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 KIR3DP1A8MWS1 328 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 SYNGR3O43761 229 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 ASPHD2Q6ICH7 369 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 IFT22Q9H7X7 185 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 HIST3H3Q16695 136 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 HCP5Q6MZN7 132 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 C1QL2Q7Z5L3 287 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 OR11H4Q8NGC9 324 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 M0R2Z0 102 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 UCP3P55916 312 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 MARCH11A6NNE9 402 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-201ENST00000418331 SELENOTP62341 195 aa18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms