RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 NXPH2O95156 264 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 CLDN1O95832 211 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 CELA3BP08861 270 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 MDKP21741 143 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVS71-1P61550 626 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 SERF2P84101 59 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC38A11Q08AI6 406 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 C9orf152Q5JTZ5 239 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP15.73■□□□□ 0.11
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SH3BP1-202ENST00000417536 VAX2Q9UIW0 290 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 CACNA1DQ01668 2161 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 SEC14L6B5MCN3 397 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 ALKBH6Q3KRA9 238 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF766Q5HY98 468 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 MRGPRGQ86SM5 289 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF383Q8NA42 475 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 MDS2Q8NDY4 140 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 GP6Q9HCN6 339 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 DMRT1Q9Y5R6 373 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 DOCK11Q5JSL3 2073 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 NCOR2Q9Y618 2525 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 LHX4Q969G2 390 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 TREM2Q9NZC2 230 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 RAMP3O60896 148 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF737O75373 536 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 KRASP01116 189 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV1D-33P01593 117 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV1-33P01594 117 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST3H2BBQ8N257 126 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 OR13D1Q8NGV5 346 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC39A9Q9NUM3 307 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 USF3Q68DE3 2245 aa15.71■□□□□ 0.11
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SH3BP1-202ENST00000417536 CD55P08174 381 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 RND2P52198 227 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXW9Q5XUX1 488 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 LURAP1LQ8IV03 231 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 P2RX4Q99571 388 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVK11-1P61568 191 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D28Q2M2D7 210 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa15.71■□□□□ 0.11
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SH3BP1-202ENST00000417536 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
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SH3BP1-202ENST00000417536 SH2D1BO14796 132 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFRSF9Q07011 255 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM7Q9BQ49 75 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRR3Q9UBC9 169 aa15.7■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 ATRXP46100 2492 aa15.7■□□□□ 0.1
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SH3BP1-202ENST00000417536 FABP4P15090 132 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 CD46P15529 392 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 SOX8P57073 446 aa15.69■□□□□ 0.1
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SH3BP1-202ENST00000417536 WDYHV1Q96HA8 205 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2D2Q9H210 308 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A22Q9H936 323 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 CLN8Q9UBY8 286 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 OR3A1P47881 315 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 CD81P60033 236 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC10A1Q14973 349 aa15.69■□□□□ 0.1
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SH3BP1-202ENST00000417536 WIPI2Q9Y4P8 454 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 PSPNO60542 156 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 SMPD2O60906 423 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 NBL1P41271 181 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL30P62888 115 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 ACSM6Q6P461 480 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 NECAP1Q8NC96 275 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX22Q96L94 193 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF212BA8MTL3 300 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF146Q15072 292 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 OPN1MWP04001 364 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 OPN1MW2P0DN77 364 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1-202ENST00000417536 OPN1MW3P0DN78 364 aa15.68■□□□□ 0.1
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