RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391058.1

RNU6-1177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UBE2L6O14933 153 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TCAPO15273 167 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MYO1DO94832 1006 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LY6G6CO95867 125 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FBP1P09467 338 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GFAPP14136 432 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CA5AP35218 305 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ARL2P36404 184 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CLDN6P56747 220 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CLDN18P56856 261 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RAB25P57735 213 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BPIFB3P59826 476 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RAB10P61026 200 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RAB14P61106 215 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FGF12P61328 243 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GTF2BQ00403 316 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KCNJ8Q15842 424 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MIAQ16674 131 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ACSM3Q53FZ2 586 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CTSL3PQ5NE16 218 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C9orf64Q5T6V5 341 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TEX261Q6UWH6 196 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AMTNQ6UX39 209 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OOSP2Q86WS3 158 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C10orf67Q8IYJ2 551 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LINC00311Q8N616 119 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OR4A4PQ8NGN8 299 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NT5CQ8TCD5 201 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RPS4Y2Q8TD47 263 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CASTOR1Q8WTX7 329 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMEM234Q8WY98 164 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PSMF1Q92530 271 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TTTY13Q9BZ97 58 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC25A31Q9H0C2 315 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 COQ10BQ9H8M1 238 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BAIAP2Q9UQB8 552 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 U3KQ87 197 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BCL9O00512 1426 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MGAMO43451 1857 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LAMC1P11047 1609 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RTL1A6NKG5 1358 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A0A0J9YW62 118 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A0A1B0GWJ7 208 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LINC00862A6NCI5 91 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAAHO00519 579 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NDUFB2O95178 105 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TACSTD2P09758 323 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TNNI1P19237 187 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RRM2P31350 389 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MAGEA2P43356 314 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 STC1P52823 247 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TAS2R39P59534 338 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RAB2AP61019 212 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RHOAP61586 193 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 COX6A2Q02221 97 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ESPL1Q14674 2120 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MAPK14Q16539 360 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NDUFA5Q16718 116 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMEM31Q5JXX7 168 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CDKL4Q5MAI5 379 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IDNKQ5T6J7 187 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC8B1Q6J4K2 584 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZNF550Q7Z398 422 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPATA12Q7Z6I5 190 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PIH1D2Q8WWB5 315 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TUBGCP3Q96CW5 907 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TPD52L3Q96J77 140 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CHP1Q99653 195 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TPPP3Q9BW30 176 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UCK2Q9BZX2 261 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TAS2R4Q9NYW5 299 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 VAPAQ9P0L0 249 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TNFSF18Q9UNG2 199 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KIF3AQ9Y496 699 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KLF12Q9Y4X4 402 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LAMA3Q16787 3333 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPAG17Q6Q759 2223 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SIP14410 1827 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCDC160A6NGH7 325 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1177P-201ENST00000391058 B4DEV8 164 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HLA-HP01893 362 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ASAH2BP0C7U1 165 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HSPA13P48723 471 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MP68P56378 58 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TAS2R45P59539 299 aa-1.6□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms