RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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PKHD1-201ENST00000340994 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.19□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.19□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.19□□□□□ -1.26
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PKHD1-201ENST00000340994 DCAF12L2Q5VW00 463 aa7.19□□□□□ -1.26
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PKHD1-201ENST00000340994 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.19□□□□□ -1.26
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PKHD1-201ENST00000340994 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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PKHD1-201ENST00000340994 CCL26Q9Y258 94 aa7.19□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM131Q92545 1883 aa7.19□□□□□ -1.26
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PKHD1-201ENST00000340994 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.19□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 GPR35Q9HC97 309 aa7.19□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 IL11RAQ14626 422 aa7.18□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 OR4D9Q8NGE8 314 aa7.18□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.18□□□□□ -1.26
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PKHD1-201ENST00000340994 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.18□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 PLXNA2O75051 1894 aa7.18□□□□□ -1.26
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PKHD1-201ENST00000340994 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.18□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.18□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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PKHD1-201ENST00000340994 C2orf83Q53S99 150 aa7.18□□□□□ -1.26
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PKHD1-201ENST00000340994 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.18□□□□□ -1.26
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PKHD1-201ENST00000340994 TNXAQ16473 311 aa7.18□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa7.18□□□□□ -1.26
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PKHD1-201ENST00000340994 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.18□□□□□ -1.26
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PKHD1-201ENST00000340994 Q6ZNB5 142 aa7.18□□□□□ -1.26
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PKHD1-201ENST00000340994 FLRT3Q9NZU0 649 aa7.18□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 H0YL77 283 aa7.17□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 KIAA0040Q15053 153 aa7.17□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.17□□□□□ -1.26
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PKHD1-201ENST00000340994 C10orf111Q8N326 155 aa7.17□□□□□ -1.26
PKHD1-201ENST00000340994 SERGEFQ9UGK8 458 aa7.17□□□□□ -1.26
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