RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327284.12

SENP6-201, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SENP6, Length 2,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-201ENST00000327284 NKX2-8O15522 239 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 HBZP02008 142 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 NECAP1Q8NC96 275 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 EDARADDQ8WWZ3 215 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 HIST1H2BKO60814 126 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 ZG16O60844 167 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 HIST1H2BJP06899 126 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 HIST1H2BOP23527 126 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 HIST1H2BBP33778 126 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 HIST1H2BDP58876 126 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 HIST1H2BCP62807 126 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 ZNF146Q15072 292 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 HIST2H2BEQ16778 126 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 HIST1H2BHQ93079 126 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 HIST1H2BNQ99877 126 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 HIST1H2BMQ99879 126 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 FAM234AQ9H0X4 552 aa15.96■□□□□ 0.15
SENP6-201ENST00000327284 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 COL8A2P25067 703 aa15.96■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 HBG1P69891 147 aa15.96■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 HBG2P69892 147 aa15.96■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 TNFRSF9Q07011 255 aa15.96■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 ACSM6Q6P461 480 aa15.96■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.149e-6■■■□□ 19
SENP6-201ENST00000327284 COQ2Q96H96 371 aa15.96■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.96■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 ODAMA1E959 279 aa15.95■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa15.95■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 ST8SIA5O15466 376 aa15.95■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 SLC25A6P12236 298 aa15.95■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 EDDM3AQ14507 147 aa15.95■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 C11orf53Q8IXP5 236 aa15.95■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 ZNF610Q8N9Z0 462 aa15.95■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 LHX4Q969G2 390 aa15.95■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 GALMQ96C23 342 aa15.95■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 MAS1LP35410 378 aa15.95■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 TFF3Q07654 80 aa15.95■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 GGACTQ9BVM4 153 aa15.95■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 KCNIP1Q9NZI2 227 aa15.95■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 ZNF883P0CG24 379 aa15.94■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 SLC35E3Q7Z769 313 aa15.94■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 GPR61Q9BZJ8 451 aa15.94■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 SLC39A9Q9NUM3 307 aa15.94■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 WIPI2Q9Y4P8 454 aa15.94■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 LINC00473A8K010 186 aa15.94■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 ZNF737O75373 536 aa15.94■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 FOXF2Q12947 444 aa15.94■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 MOB1BQ7L9L4 216 aa15.94■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 OR13A1Q8NGR1 328 aa15.94■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 TOLLIPQ9H0E2 274 aa15.94■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 SPTBN2O15020 2390 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 HOXA5P20719 270 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 ADIRFQ15847 76 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 GABRA6Q16445 453 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 PYY3Q5JQD4 70 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 SSX9Q7RTT3 188 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 OR5T1Q8NG75 326 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 ABHD5Q8WTS1 349 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 FRZBQ92765 325 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 PSG11Q9UQ72 335 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 A0A087WWC5 75 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 SOD3P08294 240 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 Q3ZCU0 254 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 TMEM41BQ5BJD5 291 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 C1QL4Q86Z23 238 aa15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 RAC2P15153 192 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 RTP5Q14D33 572 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 DPPA3Q6W0C5 159 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 Q8IYB0 196 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 ZNF645Q8N7E2 425 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 FAM210BQ96KR6 192 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 CD81P60033 236 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 S100A12P80511 92 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 TGFBR3Q03167 851 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 COL10A1Q03692 680 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 OR10D4PQ8NGN7 298 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 MBD3L1Q8WWY6 194 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 TREM2Q9NZC2 230 aa15.92■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 TRGC1P0CF51 173 aa15.91■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 TUBG1P23258 451 aa15.91■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa15.91■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa15.91■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 IQCF6A8MYZ5 107 aa15.91■□□□□ 0.14
SENP6-201ENST00000327284 FGF7P21781 194 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms