RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325438.12

PACS2-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS2, Length 3,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-201ENST00000325438 ZG16O60844 167 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 TDGF1P3P51864 188 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 TMEM147Q9BVK8 224 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 CD82P27701 267 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 CDH20Q9HBT6 801 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 TMEM242Q9NWH2 141 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
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PACS2-201ENST00000325438 DECR2Q9NUI1 292 aa20.38■□□□□ 0.85
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PACS2-201ENST00000325438 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa20.37■□□□□ 0.85
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PACS2-201ENST00000325438 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.37■□□□□ 0.85
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PACS2-201ENST00000325438 IGKV1-33P01594 117 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 CTSSP25774 331 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 PLGLB1Q02325 96 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 TRIM61Q5EBN2 209 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 C10orf128Q5T292 105 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 BORCS7Q96B45 105 aa20.36■□□□□ 0.85
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PACS2-201ENST00000325438 FAM166BA8MTA8 275 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 ADMP35318 185 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 VAMP3Q15836 100 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 ZNF439Q8NDP4 499 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 SERF1AO75920 110 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 C20orf204Q6ZNR8 217 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa20.35■□□□□ 0.85
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PACS2-201ENST00000325438 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa20.35■□□□□ 0.85
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PACS2-201ENST00000325438 OCIAD1Q9NX40 245 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 ZNF253O75346 499 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 MMDQ15546 238 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 GPR35Q9HC97 309 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 PRR14LQ5THK1 2151 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 CFAP54Q96N23 3096 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 LRP5LA4QPB2 252 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 RNF212BA8MTL3 300 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 NUPR1O60356 82 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 RAB7AP51149 207 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 TMEM54Q969K7 222 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 OBP2BQ9NPH6 170 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 TMEM250H0YL14 139 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 CHRNB4P30926 498 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 C1orf194Q5T5A4 169 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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PACS2-201ENST00000325438 MARCH11A6NNE9 402 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 ZIC3O60481 467 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 RHBDL1O75783 438 aa20.33■□□□□ 0.85
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PACS2-201ENST00000325438 ZNF573Q86YE8 665 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 SLC25A45Q8N413 288 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS2-201ENST00000325438 SRP14P37108 136 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PACS2-201ENST00000325438 VPS25Q9BRG1 176 aa20.33■□□□□ 0.84
PACS2-201ENST00000325438 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PACS2-201ENST00000325438 RNF115Q9Y4L5 304 aa20.33■□□□□ 0.84
PACS2-201ENST00000325438 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACS2-201ENST00000325438 NXPH1P58417 271 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS2-201ENST00000325438 ZIC4Q8N9L1 334 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS2-201ENST00000325438 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACS2-201ENST00000325438 DLL3Q9NYJ7 618 aa20.32■□□□□ 0.84
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