RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 CDKN1BP46527 198 aa20.89■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 LINC00310P59036 64 aa20.89■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 PPP1CBP62140 327 aa20.89■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 Q6ZSR3 168 aa20.89■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 SPSB1Q96BD6 273 aa20.89■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 GPR146Q96CH1 333 aa20.89■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 FREM1Q5H8C1 2179 aa20.89■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 NKX6-3A6NJ46 265 aa20.88■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 PDCD6O75340 191 aa20.88■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 MLF1P58340 268 aa20.88■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 MALLQ13021 153 aa20.88■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM211Q6ICI0 200 aa20.88■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 CCL28Q9NRJ3 127 aa20.88■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa20.88■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 RAC1P63000 192 aa20.88■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 OR5D13Q8NGL4 314 aa20.88■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 C10orf35Q96D05 121 aa20.88■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 SH2D2AQ9NP31 389 aa20.88■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 FOLR3P41439 243 aa20.87■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 COMPP49747 757 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 PAFAH1B2P68402 229 aa20.87■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 SLC25A22Q9H936 323 aa20.87■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 SLC22A20A6NK97 555 aa20.87■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 CBR3O75828 277 aa20.87■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF32P17041 273 aa20.87■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 SPTSSAQ969W0 71 aa20.87■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 VENTXO95231 258 aa20.86■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 ACP1P24666 158 aa20.86■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 CARD18P57730 90 aa20.86■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 B3GALT5-AS1P59052 145 aa20.86■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 C9orf135Q5VTT2 229 aa20.86■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 OR4C12Q96R67 309 aa20.86■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa20.86■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 ASCL4Q6XD76 172 aa20.86■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 VAMP5O95183 116 aa20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 OR5G3P0C626 314 aa20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 SPINK2P20155 84 aa20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 BORCS8Q96FH0 119 aa20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 TECTBQ96PL2 329 aa20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 DEPPQ9NTK1 212 aa20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 PSENENQ9NZ42 101 aa20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 PINLYPA6NC86 204 aa20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 AQP7O14520 342 aa20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 FAM27BQ5VT28 67 aa20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 Q6ZRM9 215 aa20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 ABHD3Q8WU67 409 aa20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 DOCK10Q96BY6 2186 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1W2PR80 420 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 H0Y980 276 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 SERF1AO75920 110 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 WNT2P09544 360 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 OR1L6Q8NGR2 347 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 FAM186AA6NE01 2351 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 MLNRO43193 412 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 SYNGR3O43761 229 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 P04436 131 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 SCTP09683 121 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 NPPCP23582 126 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 CLDN15P56746 228 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 GGNQ86UU5 652 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 ORAOV1Q8WV07 137 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 DOCK7Q96N67 2140 aa20.84■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 AAED1Q7RTV5 226 aa20.83■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 OR10V1Q8NGI7 309 aa20.83■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 ELOVL5Q9NYP7 299 aa20.83■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 WIPI2Q9Y4P8 454 aa20.83■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PKDCC-201ENST00000294964 DLL1O00548 723 aa20.83■□□□□ 0.92
PKDCC-201ENST00000294964 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
PKDCC-201ENST00000294964 CRYGSP22914 178 aa20.83■□□□□ 0.92
PKDCC-201ENST00000294964 HBG1P69891 147 aa20.83■□□□□ 0.92
PKDCC-201ENST00000294964 HBG2P69892 147 aa20.83■□□□□ 0.92
PKDCC-201ENST00000294964 PSG4Q00888 419 aa20.83■□□□□ 0.92
PKDCC-201ENST00000294964 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
PKDCC-201ENST00000294964 CEACAM16Q2WEN9 425 aa20.83■□□□□ 0.92
PKDCC-201ENST00000294964 ACSM6Q6P461 480 aa20.83■□□□□ 0.92
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF709Q8N972 641 aa20.83■□□□□ 0.92
PKDCC-201ENST00000294964 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa20.83■□□□□ 0.92
PKDCC-201ENST00000294964 ASPMQ8IZT6 3477 aa20.82■□□□□ 0.92
PKDCC-201ENST00000294964 HS3ST1O14792 307 aa20.82■□□□□ 0.92
PKDCC-201ENST00000294964 SYNGR2O43760 224 aa20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms