RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 UBA52P62987 128 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 MSMO1Q15800 293 aa10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 RPL39P5Q59GN2 51 aa10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 STEAP1BQ6NZ63 245 aa10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 THNSL2Q86YJ6 484 aa10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 ARRDC1Q8N5I2 433 aa10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 DRAM1Q8N682 238 aa10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF645Q8N7E2 425 aa10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 OR6F1Q8NGZ6 308 aa10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 MOB3AQ96BX8 217 aa10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 NABP2Q9BQ15 211 aa10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 SDHAF2Q9NX18 166 aa10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 TCF19Q9Y242 345 aa10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 M0QYG6 137 aa10.63□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 RAB3DO95716 219 aa10.63□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 IGLV2-14P01704 120 aa10.63□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 CD1BP29016 333 aa10.63□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 RAB13P51153 203 aa10.63□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 LSAMPQ13449 338 aa10.63□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 EBI3Q14213 229 aa10.63□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 LIAT1Q6ZQX7 453 aa10.63□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 OR56B4Q8NH76 319 aa10.63□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 ZFAND2BQ8WV99 257 aa10.63□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 S100ZQ8WXG8 99 aa10.63□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 C5orf30Q96GV9 206 aa10.63□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 CHIAQ9BZP6 476 aa10.63□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 PITPNC1Q9UKF7 332 aa10.63□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 A6NDX4 124 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 TRIM77I1YAP6 450 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 IFNA6P05013 189 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 AKAIN1P0CW23 69 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 CT45A6P0DMU7 189 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 CT45A5P0DMU8 189 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 CT45A7P0DMV0 189 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 RPL15P61313 204 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 HERV-K104P61576 105 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 TSPAN5P62079 268 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 MEF2DQ14814 521 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 MOB3BQ86TA1 216 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 LHFPL1Q86WI0 220 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM17Q86X19 198 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 OR4D10Q8NGI6 311 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 DEDD2Q8WXF8 326 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 DUX5Q96PT3 197 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 FXYD6Q9H0Q3 95 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 OR5H14A6NHG9 310 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 J3QRK9 145 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 M0R1X1 148 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF735P0CB33 412 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 FAM106CPP0CH98 169 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 FXYD4P59646 89 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 AP3S2P59780 193 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 BAK1Q16611 211 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 AADACL3Q5VUY0 350 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 C16orf87Q6PH81 154 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 C16orf82Q7Z2V1 217 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 ZBTB34Q8NCN2 500 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 OR4C16Q8NGL9 310 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 SECTM1Q8WVN6 248 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 BORCS5Q969J3 196 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 ATRQ13535 2644 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 H0YJW9 148 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 GPR137BO60478 399 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 IGKV1D-33P01593 117 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 IGKV1-33P01594 117 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 AMY2AP04746 511 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 CD24P25063 80 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 MC5RP33032 325 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 DUTP33316 252 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 UCP3P55916 312 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 LY6EQ16553 131 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 FBLN7Q53RD9 439 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 TOMM5Q8N4H5 51 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 Q8N6K4 173 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF383Q8NA42 475 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 CAPSLQ8WWF8 208 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 ADTRPQ96IZ2 230 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 AKR1E2Q96JD6 320 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 SLC5A7Q9GZV3 580 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 RAB18Q9NP72 206 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 CCL28Q9NRJ3 127 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 TNFRSF19Q9NS68 423 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 SLC2A8Q9NY64 477 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 DISC1C4P0D8 188 aa10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 CHST1O43916 411 aa10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 OR2F2O95006 317 aa10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 IL7P13232 177 aa10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 CD40LGP29965 261 aa10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 GNRHRP30968 328 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms