RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf52A6NGY3 159 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 TRGC2P03986 189 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN18P56856 261 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 FAM216AQ8WUB2 273 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 UCP3P55916 312 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 COTL1Q14019 142 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 ATG101Q9BSB4 218 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00869P0C866 280 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 SNAI3Q3KNW1 292 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 TLNRD1Q9H1K6 362 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 ICE1Q9Y2F5 2266 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 APELAP0DMC3 54 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A3Q96HJ5 214 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 MEGF10Q96KG7 1140 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 SOSTQ9BQB4 213 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-201ENST00000284617 CKAP5Q14008 2032 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 OR8G5Q8NG78 346 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 OR4C12Q96R67 309 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 RPL8P62917 257 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 PRNTQ86SH4 94 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP30Q9Y2G7 519 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 KRTCAP3Q53RY4 240 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 MMD2Q8IY49 270 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DQA1P01909 254 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 UNC119Q13432 240 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 GCGP01275 180 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 DLX1P56177 255 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 KCNMB1Q16558 191 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 SMUG1Q53HV7 270 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 SPANXN1Q5VSR9 72 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 DLL1O00548 723 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 UBTD1Q9HAC8 227 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 ODAMA1E959 279 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 MDKP21741 143 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 IL36RNQ9UBH0 155 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 KLF4O43474 513 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 ECSCRQ19T08 205 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 KLK2P20151 261 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 ITLN1Q8WWA0 313 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 MGPP08493 103 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 DANCRP0C864 163 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 APCDD1LQ8NCL9 501 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 WNT2BQ93097 391 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF9Q07011 255 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 CD8AP01732 235 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 ID1P41134 155 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf128Q5T292 105 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 OR52M1Q8NGK5 317 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 HSPB9Q9BQS6 159 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 PCGF1Q9BSM1 259 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV3-11P04433 115 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 RND3P61587 244 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 LOXL4Q96JB6 756 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 J3KRW8 73 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 IFNL4K9M1U5 179 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 H0YL77 283 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 AREGP15514 252 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF826PQ6ZT77 177 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 POC1AQ8NBT0 407 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM140Q9NV12 185 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 COL4A5P29400 1685 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 COMPP49747 757 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 EGR4Q05215 589 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 OR4A5Q8NH83 315 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 SAP25Q8TEE9 199 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 RABAC1Q9UI14 185 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM229AB2RXF0 380 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM187Q14656 261 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 MIC13Q5XKP0 118 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 OR1P1Q8NH06 330 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM45BQ96B21 275 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-201ENST00000284617 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.2 ms