RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 CGB7P0DN87 165 aa12.09□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 GNLYP22749 145 aa12.09□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 G6PCP35575 357 aa12.09□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 ZNF134P52741 427 aa12.09□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 RPL31P62899 125 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 ZNF66Q6ZN08 573 aa12.09□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 LINC00473A8K010 186 aa12.08□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 M0R1X1 148 aa12.08□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 NDUFB3O43676 98 aa12.08□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 SLC25A6P12236 298 aa12.08□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 MSMO1Q15800 293 aa12.08□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 SWI5Q1ZZU3 235 aa12.08□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 LYPD2Q6UXB3 125 aa12.08□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 GFOD1Q9NXC2 390 aa12.08□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 AUP1Q9Y679 476 aa12.08□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.47
NICN1-201ENST00000273598 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa12.08□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 I3L521 148 aa12.08□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 FBXO24O75426 580 aa12.08□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 S1PR2O95136 353 aa12.08□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 TFF3Q07654 80 aa12.08□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 RPL39P5Q59GN2 51 aa12.08□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 LRRC10Q5BKY1 277 aa12.08□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 UTF1Q5T230 341 aa12.08□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa12.08□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 LYNX1G3V0Z9 82 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 SLC31A2O15432 143 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 PITX3O75364 302 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 ATG12O94817 140 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 LYNX1P0DP58 116 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 GNG10P50151 68 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 TCF23Q7RTU1 214 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 SLC25A31Q9H0C2 315 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 RAB7AP51149 207 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 NCR3LG1Q68D85 454 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 C19orf12Q9NSK7 152 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 MMP24Q9Y5R2 645 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 H3BP45 60 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 KALRNO60229 2985 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 FCGR3BO75015 233 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 DUTP33316 252 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 CT45A1Q5HYN5 189 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 CT45A3Q8NHU0 189 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 RNF141Q8WVD5 230 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 IFI27L2Q9H2X8 130 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 LINC00312Q9Y6C7 94 aa12.07□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 TANC2Q9HCD6 1990 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 IGSF23A1L1A6 192 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 PROP1O75360 226 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 MMP23AO75900 390 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 CST7O76096 145 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 BRWD1-AS2P59051 145 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 ERVFRD-1P60508 538 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 ZNF273Q14593 569 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 CLINT1Q14677 625 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 AANATQ16613 207 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 LYG1Q8N1E2 194 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 TMEM252Q8N6L7 170 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 TMEM217Q8N7C4 229 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 CORO2AQ92828 525 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 DSCAML1Q8TD84 2053 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 DVL1O14640 695 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 SYNGR2O43760 224 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 TMEM50AO95807 157 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 IAPPP10997 89 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 COL8A2P25067 703 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 C4orf17Q53FE4 359 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 CD300LFQ8TDQ1 290 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 C11orf1Q9H5F2 150 aa12.06□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 MMP9P14780 707 aa12.05□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 TMEM204Q9BSN7 226 aa12.05□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 WFDC1Q9HC57 220 aa12.05□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 LAMP3Q9UQV4 416 aa12.05□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa12.05□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 ITPR1Q14643 2758 aa12.05□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 ACACBO00763 2458 aa12.05□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 CCL3L1P16619 93 aa12.05□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 LOXP28300 417 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 TMEM200BQ69YZ2 307 aa12.05□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 LRRC20Q8TCA0 184 aa12.05□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 FAM216AQ8WUB2 273 aa12.05□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 ZNF714Q96N38 554 aa12.05□□□□□ -0.48
NICN1-201ENST00000273598 RAB40CQ96S21 281 aa12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms