RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625245.2

SMN1-211, Transcript of survival of motor neuron 1, telomeric, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SMN1, Length 885 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1-211ENST00000625245 OR4C12Q96R67 309 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 H7C2Y5 167 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 FCN1O00602 326 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 OR8U9P0C7N5 309 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 CELP19835 753 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 TAS2R43P59537 309 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 ST3GAL4Q11206 333 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 HMGN3Q15651 99 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 OR10K2Q6IF99 312 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 LYPD6Q86Y78 171 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 SETD6Q8TBK2 473 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 GGHQ92820 318 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 CLCC1Q96S66 551 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 TPSG1Q9NRR2 321 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 RAB29O14966 203 aa14.62□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 CT45A6P0DMU7 189 aa14.62□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 CT45A5P0DMU8 189 aa14.62□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 CT45A7P0DMV0 189 aa14.62□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 ACTBL2Q562R1 376 aa14.62□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.62□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.62□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.62□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa14.62□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 GHRLQ9UBU3 117 aa14.62□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 RNF150Q9ULK6 438 aa14.62□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 TPPP2P59282 170 aa14.61□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 ZFAND6Q6FIF0 208 aa14.61□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.61□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 HAPLN4Q86UW8 402 aa14.61□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.61□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.61□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 GAB2Q9UQC2 676 aa14.61□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 OR5H14A6NHG9 310 aa14.6□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 CD40LGP29965 261 aa14.6□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 MC5RP33032 325 aa14.6□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 TTC23Q5W5X9 447 aa14.6□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.6□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.6□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 SETD9Q8NE22 299 aa14.6□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 LFNGQ8NES3 379 aa14.6□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 RSRP1Q9BUV0 290 aa14.6□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.6□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.6□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.59□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 H0YJW9 148 aa14.59□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 MYL12BO14950 172 aa14.59□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 UBBP0CG47 229 aa14.59□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 SVOPQ8N4V2 548 aa14.59□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 THRSPQ92748 146 aa14.59□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 CITED4Q96RK1 184 aa14.59□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.59□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.59□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 RYR2Q92736 4967 aa14.59□□□□□ -0.07
SMN1-211ENST00000625245 RBBP9O75884 186 aa14.58□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 TRGV3P03979 118 aa14.58□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 HTR2CP28335 458 aa14.58□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 WNT4P56705 351 aa14.58□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 INSL4Q14641 139 aa14.58□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 AKIRIN2Q53H80 203 aa14.58□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.58□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 RHOVQ96L33 236 aa14.58□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 NICN1Q9BSH3 213 aa14.58□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 KCNK15Q9H427 330 aa14.58□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 LDLRAD4O15165 306 aa14.57□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 HSPA12AO43301 675 aa14.57□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 CA2P00918 260 aa14.57□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 CD1AP06126 327 aa14.57□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.57□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 CEACAM6P40199 344 aa14.57□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 PSG5Q15238 335 aa14.57□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.57□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 GLT8D1Q68CQ7 371 aa14.57□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 AHSA2Q719I0 299 aa14.57□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.57□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SMN1-211ENST00000625245 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms