RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619785.1

SENP3-210, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-210ENST00000619785 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 FUOMA2VDF0 154 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 MPZL2O60487 215 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 ENTPD6O75354 484 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 KRT36O76013 467 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 IFNGP01579 166 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 OR8U9P0C7N5 309 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 OR5H8P0DN80 308 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 ZNF3P17036 446 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 RRM2P31350 389 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 MAGEA2P43356 314 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 GNB1P62873 340 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 MADCAM1Q13477 382 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 LINC00311Q8N616 119 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 OR10A7Q8NGE5 316 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 OR51E1Q8TCB6 317 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 TOMM40LQ969M1 308 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 RPEQ96AT9 228 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 RCN3Q96D15 328 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 COQ2Q96H96 371 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 PYURFQ96I23 114 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 NABP2Q9BQ15 211 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 TSSK6Q9BXA6 273 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 YIPF3Q9GZM5 350 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 GNB4Q9HAV0 340 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 RHOFQ9HBH0 211 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 VSIG4Q9Y279 399 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 U3KQV3 271 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 PKD1P98161 4303 aa5.5□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 ODAMA1E959 279 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 RIIAD1A6NNX1 92 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 TOR1AO14656 332 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 IGKV1D-33P01593 117 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 IGKV1-33P01594 117 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 IFNA6P05013 189 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 NCK1P16333 377 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 PTGFRP43088 359 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 ZNF137PP52743 207 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 EDDM3AQ14507 147 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 LCE4AQ5TA78 99 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 GLYATQ6IB77 296 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 ANGPTL5Q86XS5 388 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 STHQ8IWL8 128 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 LRTM2Q8N967 370 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 MINDY2Q8NBR6 621 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 OR9Q2Q8NGE9 314 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 ZBTB9Q96C00 473 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 C10orf35Q96D05 121 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 KCTD7Q96MP8 289 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 HSPB9Q9BQS6 159 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 CHST5Q9GZS9 411 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 CHST6Q9GZX3 395 aa5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 A0A0G2JND7 137 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 A0A1W2PS18 150 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 FAM183AA6NL82 134 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 SAP30O75446 220 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 CLN5O75503 358 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 CD1BP29016 333 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 DUTP33316 252 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 VHLP40337 213 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 POU3F4P49335 361 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 HERV-K104P61576 105 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 GK3PQ14409 553 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 UBE2V2Q15819 145 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 Q3ZCU0 254 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 Q6P435 159 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 ASRGL1Q7L266 308 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 CHST4Q8NCG5 386 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 CCDC54Q8NEL0 328 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 SLC24A4Q8NFF2 622 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 OR4D6Q8NGJ1 314 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 OR51T1Q8NGJ9 327 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 OR2T10Q8NGZ9 312 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 THEM6Q8WUY1 208 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SENP3-210ENST00000619785 S1PR3Q99500 378 aa5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms