RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 PDPNQ86YL7 162 aa17.76■□□□□ 0.43
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PTPRJ-208ENST00000615445 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 TEPPQ6URK8 271 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 RASL11BQ9BPW5 248 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 RD3LP0DJH9 198 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 OR10C1Q96KK4 312 aa17.76■□□□□ 0.43
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PTPRJ-208ENST00000615445 UNC119Q13432 240 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 CBLN2Q8IUK8 224 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 SEC11CQ9BY50 192 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
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PTPRJ-208ENST00000615445 C9orf172C9J069 976 aa17.74■□□□□ 0.43
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PTPRJ-208ENST00000615445 GP6Q9HCN6 339 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC25A53Q5H9E4 307 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 OR11H4Q8NGC9 324 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 PITX3O75364 302 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 VWA1Q6PCB0 445 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 FGFRL1Q8N441 504 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 PHOX2AO14813 284 aa17.74■□□□□ 0.43
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PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
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PTPRJ-208ENST00000615445 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa17.73■□□□□ 0.43
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PTPRJ-208ENST00000615445 Q5BKY6 102 aa17.73■□□□□ 0.43
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PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF645Q8N7E2 425 aa17.73■□□□□ 0.43
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PTPRJ-208ENST00000615445 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 SEC14L6B5MCN3 397 aa17.72■□□□□ 0.43
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PTPRJ-208ENST00000615445 C1QL1O75973 258 aa17.72■□□□□ 0.43
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PTPRJ-208ENST00000615445 BMI1P35226 326 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 SIP14410 1827 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa17.72■□□□□ 0.43
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PTPRJ-208ENST00000615445 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
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PTPRJ-208ENST00000615445 SRP14P37108 136 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 CAMPP49913 170 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 ASPHD2Q6ICH7 369 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR146Q96CH1 333 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC2A8Q9NY64 477 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 DLK1P80370 383 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 OR8I2Q8N0Y5 310 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRJ-208ENST00000615445 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa17.71■□□□□ 0.43
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