RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 NUBPLQ8TB37 319 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PNR3 127 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 CD74P04233 296 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 TM4SF19Q96DZ7 209 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 DHHO43323 396 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 MALP21145 153 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 RTP5Q14D33 572 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 PMVKQ15126 192 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 C17orf99Q6UX52 265 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 GFRALQ6UXV0 394 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM86BQ8N661 226 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 TRPM7Q96QT4 1865 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM157BP0CG42 384 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 MTCH2Q9Y6C9 303 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 MPTX1A8MV57 137 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 NPFFO15130 113 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FCGR3BO75015 233 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 MOSPD3O75425 235 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM106CPP0CH98 169 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFA2O43678 99 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 IRF3Q14653 427 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF77Q15935 545 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 DPH3Q96FX2 82 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 HPRT1P00492 218 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 LCN2P80188 198 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 C10orf111Q8N326 155 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 CDAP32320 146 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 TMPRSS3P57727 454 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 HBBP68871 147 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV4-34P06331 123 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 DAOP14920 347 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 C2orf83Q53S99 150 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 PAXXQ9BUH6 204 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 PLPP3O14495 311 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 SIGLEC5O15389 551 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 CD1AP06126 327 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 CSN3P07498 182 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ABHD3Q8WU67 409 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ZBP1Q9H171 429 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 SP9P0CG40 484 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ISXQ2M1V0 245 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 MESTQ5EB52 335 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 TMPRSS2O15393 492 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 NKX2-2O95096 273 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF117Q03924 483 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 MFAP2P55001 183 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 OR4X1Q8NH49 305 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 GGTLC3B5MD39 225 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 NAPSAO96009 420 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-209ENST00000612229 LILRA5A6NI73 299 aa6.12□□□□□ -1.43
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