RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-215	ENST00000596522	BEST4	Q8NFU0	473 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FCHO1-215	ENST00000596522	PIFO	Q8TCI5	191 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FCHO1-215	ENST00000596522	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FCHO1-215	ENST00000596522	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
FCHO1-215	ENST00000596522	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FCHO1-215	ENST00000596522	BEX1	Q9HBH7	125 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FCHO1-215	ENST00000596522	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF221	Q9UK13	617 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FCHO1-215	ENST00000596522	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FCHO1-215	ENST00000596522	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FCHO1-215	ENST00000596522	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	SSX5	O60225	188 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	OR2F2	O95006	317 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	TAS2R46	P59540	309 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	LY6E	Q16553	131 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	MOB3B	Q86TA1	216 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	OR56B4	Q8NH76	319 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	GAB2	Q9UQC2	676 aa		11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	ST8SIA5	O15466	376 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	TSPAN9	O75954	239 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	GPR12	P47775	334 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	ACTB	P60709	375 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	IGSF11	Q5DX21	431 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	DRAM1	Q8N682	238 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	MCFD2	Q8NI22	146 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	CFHR4	Q92496	578 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	C16orf95	Q9H693	158 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	C1RL	Q9NZP8	487 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	FGF16	O43320	207 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	HLA-DQB1	P01920	261 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM11	P17152	192 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	MC5R	P33032	325 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	RCVRN	P35243	200 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	REG1B	P48304	166 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	RAB13	P51153	203 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	LSAMP	Q13449	338 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	EBI3	Q14213	229 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	HES1	Q14469	280 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	ACTBL2	Q562R1	376 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	BORCS5	Q969J3	196 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	MMP27	Q9H306	513 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		11.37	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	RBBP9	O75884	186 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	MOS	P00540	346 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	IGKV1-33	P01594	117 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	NAT1	P18440	290 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	PAX6	P26367	422 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	S100A5	P33763	92 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	OR3A3	P47888	321 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	CDK10	Q15131	360 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	MSMO1	Q15800	293 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	GPX8	Q8TED1	209 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	OR2D2	Q9H210	308 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		11.36	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	APOA2	P02652	100 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	OR8U9	P0C7N5	309 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	OR5H8	P0DN80	308 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	TBP	P20226	339 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	CBX3	Q13185	183 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FCHO1-215	ENST00000596522	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		11.35	□□□□□ -0.59

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