RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 OR5AK2Q8NH90 309 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 SDSLQ96GA7 329 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 CSTL1Q9H114 145 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ATRQ13535 2644 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM212A6NML5 194 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNAB3O43448 404 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 NXPH2O95156 264 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 CYB5AP00167 134 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 OCM2P0CE71 109 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 MYL12AP19105 171 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 CD1BP29016 333 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 HILS1P60008 231 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ERVK11-1P61568 191 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ST3GAL4Q11206 333 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 Q6ZRG5 221 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 CALHM1Q8IU99 346 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF561Q8N587 486 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF488Q96MN9 340 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 GAFA1Q96PS6 74 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 CHST5Q9GZS9 411 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 GHRLQ9UBU3 117 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 KPTNQ9Y664 436 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 COL6A5A8TX70 2615 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A087WZ39 114 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC1A7O00341 560 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 FCN3O75636 299 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 HSMCR30P0CW71 290 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 AADACP22760 399 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 FHL2Q14192 279 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 DGUOKQ16854 277 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR157Q5UAW9 335 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 Q8IYB0 196 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 STX19Q8N4C7 294 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 CD177Q8N6Q3 437 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 CEP19Q96LK0 163 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 OPALINQ96PE5 141 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 TBX15Q96SF7 602 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC6A7Q99884 636 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 RHOFQ9HBH0 211 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 HES4Q9HCC6 221 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 SCN3BQ9NY72 215 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 GNG12Q9UBI6 72 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 GLS2Q9UI32 602 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF222Q9UK12 451 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GW55 424 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 H0YHG0 523 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 TFF1P04155 84 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 CD2P06729 351 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 PRKACAP17612 351 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 PRTN3P24158 256 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB9AP51151 201 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 BAMBIQ13145 260 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-216ENST00000590105 RIGQ13278 110 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms