RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589296.5

CYTH1-209, Transcript of cytohesin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CYTH1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1-209ENST00000589296 LCN15Q6UWW0 184 aa15.96■□□□□ 0.15
CYTH1-209ENST00000589296 TRAV20A0A0B4J274 112 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 HIST1H2BKO60814 126 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 HIST1H2BJP06899 126 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 HIST1H2BOP23527 126 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 HIST1H2BBP33778 126 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 HIST1H2BDP58876 126 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 HIST1H2BCP62807 126 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 PMP22Q01453 160 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 HIST2H2BEQ16778 126 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 OR1K1Q8NGR3 316 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 HIST1H2BHQ93079 126 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 FAM210BQ96KR6 192 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 HIST1H2BNQ99877 126 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 HIST1H2BMQ99879 126 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 SCNM1Q9BWG6 230 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 CTDSP1Q9GZU7 261 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 ZNF665Q9H7R5 613 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 OR14J1Q9UGF5 321 aa15.96■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 SPINK2P20155 84 aa15.95■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 ZNF585BQ52M93 769 aa15.95■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa15.95■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 SDF2L1Q9HCN8 221 aa15.95■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 TIMM9Q9Y5J7 89 aa15.95■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 PPP1R2P9O14990 202 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 OR2H2O95918 312 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 ARL16Q0P5N6 197 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 ZNF726P1Q15940 193 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 ZBTB34Q8NCN2 500 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 WDYHV1Q96HA8 205 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 WIPI2Q9Y4P8 454 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 IGHG3P01860 377 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 OPN1MWP04001 364 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 OPN1MW2P0DN77 364 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 OPN1MW3P0DN78 364 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 TBC1D28Q2M2D7 210 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 FAM209BQ5JX69 171 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 IGFL3Q6UXB1 125 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 PRR18Q8N4B5 295 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 VSIRQ9H7M9 311 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 SPRR3Q9UBC9 169 aa15.94■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 SIRPB1O00241 398 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 SH2D1BO14796 132 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 WDR1O75083 606 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 TRGC2P03986 189 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 ERVK11-1P61568 191 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 C3AR1Q16581 482 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 SPANXN5Q5MJ07 72 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 HAPLN4Q86UW8 402 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 EDARADDQ8WWZ3 215 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 OR51B6Q9H340 312 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 GP6Q9HCN6 339 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 PRSS50Q9UI38 385 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 IFITM10A6NMD0 228 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 IL18BPO95998 194 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 CEACAM6P40199 344 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 ZNF146Q15072 292 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 FBXW9Q5XUX1 488 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 MDP1Q86V88 176 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 OR4C12Q96R67 309 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa15.93■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 CEBPZOSA8MTT3 80 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 SLC38A11Q08AI6 406 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 MSMO1Q15800 293 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 ATP6V1FQ16864 119 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 FGFRL1Q8N441 504 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 DRAM1Q8N682 238 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 SCCPDHQ8NBX0 429 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 SLC39A9Q9NUM3 307 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 KCNIP1Q9NZI2 227 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 ASPMQ8IZT6 3477 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 A0A1W2PR80 420 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 GATCO43716 136 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 CD81P60033 236 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 PYY3Q5JQD4 70 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 DNLZQ5SXM8 178 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 AGMATQ9BSE5 352 aa15.92■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 FREM1Q5H8C1 2179 aa15.91■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 ZNF737O75373 536 aa15.91■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 PGA5P0DJD9 388 aa15.91■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 SPNS3Q6ZMD2 512 aa15.91■□□□□ 0.14
CYTH1-209ENST00000589296 C12orf49Q9H741 205 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms