RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 WNT2P09544 360 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 GP9P14770 177 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 C4BPBP20851 252 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 CRHBPP24387 322 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 MAP2K4P45985 399 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 FHITP49789 147 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 WNT4P56705 351 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 RYR3Q15413 4870 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 RNLSQ5VYX0 342 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
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ATG4D-210ENST00000588972 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 PP6455Q8WZ26 134 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 GHSRQ92847 366 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 MYDGFQ969H8 173 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 SMIM19Q96E16 107 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 BORCS8Q96FH0 119 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 OPALINQ96PE5 141 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 TECTBQ96PL2 329 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 OR8B2Q96RD0 313 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 RAB40CQ96S21 281 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 CCL13Q99616 98 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 MND1Q9BWT6 205 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 DUSP21Q9H596 190 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 MMP26Q9NRE1 261 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 A0A087WXM4 84 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 A8MXK9 166 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 SULT1B1O43704 296 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 FSTL3O95633 263 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 SERPINA3P01011 423 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
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ATG4D-210ENST00000588972 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 PGA5P0DJD9 388 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 ATF1P18846 271 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 CELP19835 753 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 CFHR2P36980 270 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 POU3F4P49335 361 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 RBP2P50120 134 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 GNB2P62879 340 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 MICBQ29980 383 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 MAJINQ3KP22 176 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
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ATG4D-210ENST00000588972 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 UTS2BQ765I0 119 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 SMIM29Q86T20 159 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 ITFG2Q969R8 447 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM106AQ96A25 262 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 C10orf35Q96D05 121 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 GAFA1Q96PS6 74 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 OPN4Q9UHM6 478 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.11□□□□□ -1.43
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ATG4D-210ENST00000588972 FOXH1O75593 365 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 NXPH2O95156 264 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 HCKP08631 526 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 PSG2P11465 335 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 BCL3P20749 454 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 GABRA2P47869 451 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 NPBWR2P48146 333 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 ATP1B3P54709 279 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 TAS2R43P59537 309 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 PAX2Q02962 417 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 IL24Q13007 206 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 INSL4Q14641 139 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 KCNJ8Q15842 424 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF585BQ52M93 769 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF773Q6PK81 442 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4D-210ENST00000588972 Q6ZRG5 221 aa6.1□□□□□ -1.43
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