RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 CA11O75493 328 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 HBZP02008 142 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 GLAP06280 429 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CPEP16870 476 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM11P17152 192 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TPBGQ13641 420 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 PLET1Q6UQ28 207 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LYPD6Q86Y78 171 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR8H3Q8N146 312 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR1L1Q8NH94 360 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CFHR4Q92496 578 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 AP3S1Q92572 193 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0B4J293 547 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PRX2 142 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 C12orf77C9JDV5 145 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SNAPC5O75971 98 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1D-33P01593 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1-33P01594 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 UCHL1P09936 223 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 VSIG8P0DPA2 414 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ARSBP15848 533 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 NAT1P18440 290 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 P2RY14Q15391 338 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 RAB11BQ15907 218 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 FBLN7Q53RD9 439 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 C1QL4Q86Z23 238 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 R3HDM4Q96D70 268 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 KCNK15Q9H427 330 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PPI3 338 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINE3A8MV23 424 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SLC31A2O15432 143 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 RGS5O15539 181 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 KCNAB3O43448 404 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SC5DO75845 299 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A5O76082 557 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 BPNT1O95861 308 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 GALP22466 123 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SDC2P34741 201 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 LOXL3P58215 753 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 CD83Q01151 205 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 FABP5Q01469 135 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 Q3ZCU0 254 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 PYDC2Q56P42 97 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 HACD4Q5VWC8 232 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 LAX1Q8IWV1 398 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-214ENST00000583153 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.63□□□□□ -1.35
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