RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 GALNT14Q96FL9 552 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 CCDC140Q96MF4 163 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 ALG8Q9BVK2 526 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 HRH4Q9H3N8 390 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 FAM223BA6NKX1 122 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 MPTX1A8MV57 137 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 PPP5D1E7EU14 171 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 H0YJW9 148 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 ARPC2O15144 300 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 SULT1B1O43704 296 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
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GGA3-212ENST00000582376 HTR3BO95264 441 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 IFNA10P01566 189 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 AMBPP02760 352 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 CT45A6P0DMU7 189 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 CT45A5P0DMU8 189 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 CT45A7P0DMV0 189 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 HLA-DMBP28068 263 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
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GGA3-212ENST00000582376 ATP5G2Q06055 141 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.73□□□□□ -1.33
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GGA3-212ENST00000582376 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 Q6ZRM9 215 aa6.73□□□□□ -1.33
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GGA3-212ENST00000582376 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 OR2T29Q8NH02 315 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 OR4K15Q8NH41 348 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 OR4A5Q8NH83 315 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 GIPC3Q8TF64 312 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 TBX5Q99593 518 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 CSTL1Q9H114 145 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 JPT1Q9UK76 154 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 TMEM213A2RRL7 107 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 SULT1C4O75897 302 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 OR2C1O95371 312 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 T-ENOLP0DO92 83 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 OSMP13725 252 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 RHOGP84095 191 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 SPATS1Q496A3 300 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 FAM209BQ5JX69 171 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 Q6ZTC4 211 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 GPHB5Q86YW7 130 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-212ENST00000582376 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 ZNF320A2RRD8 509 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 A8MWP6 167 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 H3BNX3 289 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 SNX3O60493 162 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 YPEL1O60688 119 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 IFNA21P01568 189 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 IFNA17P01571 189 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 ISG15P05161 165 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 HSD17B1P14061 328 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 ADMP35318 185 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 RIPK1Q13546 671 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 LPCAT4Q643R3 524 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 OR4A47Q6IF82 309 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 LINC00596Q86U02 117 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 OR5B3Q8NH48 314 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-212ENST00000582376 OR52N1Q8NH53 320 aa6.71□□□□□ -1.34
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