RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 MUC15Q8N387 334 aa18.48■□□□□ 0.55
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PTPRM-211ENST00000580170 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 TWIST1Q15672 202 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 CCL13Q99616 98 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-211ENST00000580170 QSER1Q2KHR3 1735 aa18.44■□□□□ 0.54
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