RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 UNC13CQ8NB66 2214 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 EFEMP2O95967 443 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 CAMPP49913 170 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 SNAI3Q3KNW1 292 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 C1QL4Q86Z23 238 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 FAM89BQ8N5H3 189 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF738Q8NE65 137 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 IL36GQ9NZH8 169 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 hADV38S2A0JD32 116 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 M0R1B8 84 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 RAB29O14966 203 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 MEOX1P50221 254 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 PDPNQ86YL7 162 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 FGFRL1Q8N441 504 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM230Q96A57 120 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 IER2Q9BTL4 223 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 TCL1AP56279 114 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 TNFRSF9Q07011 255 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 FNDC7Q5VTL7 733 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 FAM166AQ6J272 317 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 LDLRAD4O15165 306 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 CTSBP07858 339 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM54Q969K7 222 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 FAM186AA6NE01 2351 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 NPIPB7O75200 414 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 CHRNB4P30926 498 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 NHLH1Q02575 133 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 COA4Q9NYJ1 87 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 SYNGR1O43759 233 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 CCL1P22362 96 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 VASH2Q86V25 355 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 TCFL5Q9UL49 500 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 SMPD2O60906 423 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 LGALS4P56470 323 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 ARL16Q0P5N6 197 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 TDHQ8IZJ6 230 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 OR5R1Q8NH85 324 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 Q8WTZ3 238 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1B0GW64 132 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 NDUFA2O43678 99 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 CLDN14O95500 239 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 LRTM2Q8N967 370 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 WIPI2Q9Y4P8 454 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 K7ERU9 68 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 K7N7A8 449 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 CFPP27918 469 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 GNB1P62873 340 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 TFF2Q03403 129 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 HES1Q14469 280 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 OR5AL1P0C617 328 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 STARD6P59095 220 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 A0A087WV48 116 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRM-205ENST00000577827 SPRY3O43610 288 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms