RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNAPC3Q92966 411 aa26.63■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM181BA6NEQ2 426 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 SULT1C2O00338 296 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIMM23O14925 209 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB29O14966 203 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR137BO60478 399 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 LIAT1Q6ZQX7 453 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa26.61■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 LANCL1O43813 399 aa26.61■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABHD1Q96SE0 405 aa26.61■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 FCER2P06734 321 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM71F2Q6NXP2 309 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFHR4Q92496 578 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 RABL2BQ9UNT1 228 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL6A5A8TX70 2615 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 DRAM1Q8N682 238 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5AP2Q8NGF4 316 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR56B4Q8NH76 319 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABHD14BQ96IU4 210 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB18Q9NP72 206 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF212BA8MTL3 300 aa26.59■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAT1P18440 290 aa26.59■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR3A3P47888 321 aa26.59■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 MOB3BQ86TA1 216 aa26.59■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 S1PR3Q99500 378 aa26.59■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 NECAP2Q9NVZ3 263 aa26.59■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 A6NDX4 124 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRYBA1P05813 215 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD24P25063 80 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFSF8P32971 234 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 THNSL2Q86YJ6 484 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 C19orf24Q9BVV8 132 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR8U9P0C7N5 309 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM106CPP0CH98 169 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 PYHIN1Q6K0P9 492 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR8U1Q8NH10 309 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF251Q9BRH9 671 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF221Q9UK13 617 aa26.57■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 S100A5P33763 92 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACTG1P63261 375 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL18Q14116 193 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAPSLQ8WWF8 208 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF150Q9ULK6 438 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR12P47775 334 aa26.55■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2W1Q9Y3N9 320 aa26.55■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-209ENST00000574205 A6NHS1 94 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 RCVRNP35243 200 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R46P59540 309 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDK10Q15131 360 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL39P5Q59GN2 51 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2D2Q9H210 308 aa26.55■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHST1O43916 411 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5H8P0DN80 308 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52I2Q8NH67 350 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 FCAMRQ8WWV6 532 aa26.54■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CD1BP29016 333 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACTBP60709 375 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 NABP2Q9BQ15 211 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLK11Q9UBX7 282 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAB2Q9UQC2 676 aa26.53■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 FABP12A6NFH5 140 aa26.52■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TUSC2O75896 110 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 HES1Q14469 280 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf82Q7Z2V1 217 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYSMD2Q8IV50 215 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5H2Q8NGV7 314 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 MDFIQ99750 246 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1RLQ9NZP8 487 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTFP1Q9UDX5 166 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTDSPLO15194 276 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBBP9O75884 186 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV1D-33P01593 117 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV1-33P01594 117 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 HLA-DMAP28067 261 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 LUMP51884 338 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 LSAMPQ13449 338 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 EBI3Q14213 229 aa26.51■■□□□ 1.83
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