RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 STEAP3Q658P3 488 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 LYG1Q8N1E2 194 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 GALMQ96C23 342 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 AGMATQ9BSE5 352 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.78□□□□□ -1.32
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM235A6NFC5 223 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 SERPINE3A8MV23 424 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 FABP7O15540 132 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 GABARAPO95166 117 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 TFAP2AP05549 437 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM11P17152 192 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 SCAND1P57086 179 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 VBP1P61758 197 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 LSAMPQ13449 338 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 HNF4GQ14541 408 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 CTF1Q16619 201 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 IGSF11Q5DX21 431 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 PRR31Q5SQ13 230 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 C11orf88Q6PI97 169 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 Q6ZS49 121 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 MOB3BQ86TA1 216 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 RITA1Q96K30 269 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 NABP2Q9BQ15 211 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 RAB9BQ9NP90 201 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 ETV7Q9Y603 341 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 TRDCB7Z8K6 153 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 ITGB1BP1O14713 200 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 TSPAN15O95858 294 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 GSTT2P0CG29 244 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 GSTT2BP0CG30 244 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 FAM106CPP0CH98 169 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 PTHLHP12272 177 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 IL3RAP26951 378 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 CD1BP29016 333 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 RANBP1P43487 201 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 ARHGDIBP52566 201 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 LINC00205P59089 165 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 CDNFQ49AH0 187 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 HACD4Q5VWC8 232 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 Q8N9W7 124 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 PLXNB1O43157 2135 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 FGF16O43320 207 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 TXNL1O43396 289 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 RGS11O94810 467 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 LPLP06858 475 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 CT45A6P0DMU7 189 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 CT45A5P0DMU8 189 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 CT45A7P0DMV0 189 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 CD28P10747 220 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 DTYMKP23919 212 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 CNTFRP26992 372 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 CEACAM6P40199 344 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 SERPINB10P48595 397 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 F2RL1P55085 397 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 ARFRP1Q13795 201 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 HES1Q14469 280 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CCDC33-211ENST00000563951 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms