RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560715.5

TSPAN3-209, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 2,892 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-209ENST00000560715 OR4K13Q8NH42 304 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 DYRK2Q92630 601 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 NUDT9Q9BW91 350 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 SMPXQ9UHP9 88 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 LINC01553A4QN01 128 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 LYPD3O95274 346 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 CATP04040 527 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF43P17038 809 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 TCN2P20062 427 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 AK4P27144 223 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 GRPRP30550 384 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF136P52737 540 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 BIDP55957 195 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 CLDN6P56747 220 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 CSNK1G2P78368 415 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 TCF24Q7RTU0 167 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 BET1LQ9NYM9 111 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 OR5B21A6NL26 309 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 SEMA4FO95754 770 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 TYMSP04818 313 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 CTRLP40313 264 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 NBL1P41271 181 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 RIPPLY3P57055 190 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 TBPL1P62380 186 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 ID2Q02363 134 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 NSDHLQ15738 373 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 VAMP3Q15836 100 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 SNAI3Q3KNW1 292 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 TCEAL5Q5H9L2 206 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM89BQ8N5H3 189 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 OR6K6Q8NGW6 343 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 OR4S2Q8NH73 311 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 UBE2E3Q969T4 207 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 REEP6Q96HR9 211 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 FOXN4Q96NZ1 517 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 OR7D2Q96RA2 312 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 ULBP2Q9BZM5 246 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 CLN8Q9UBY8 286 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 AK3Q9UIJ7 227 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 MED31Q9Y3C7 131 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 A0A1B0GTH9 108 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 A0A1B0GVT2 93 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF814B7Z6K7 855 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 RAB29O14966 203 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 NDUFA7O95182 113 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 CISD3P0C7P0 127 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 PPIAL4GP0DN37 164 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 GLRA1P23415 457 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 ERVS71-1P61550 626 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 PAFAH1B2P68402 229 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 NTHL1P78549 312 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 GLYATL3Q5SZD4 288 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 Q6ZN92 141 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 TMEM256Q8N2U0 113 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 LRRK1Q38SD2 2015 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 CORTO00230 105 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 SPINT2O43291 252 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 NUPR1O60356 82 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 HYPMO75409 117 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 HBE1P02100 147 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 PSG1P11464 419 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 PSMB5P28074 263 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 LGALS7P47929 136 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 TPPP2P59282 170 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 FHL1Q13642 323 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 OR1Q1Q15612 314 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 FNDC9Q8TBE3 224 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 VN1R17PQ8TDU5 208 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 OR5B12Q96R08 314 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 ULBP3Q9BZM4 244 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 GPR84Q9NQS5 396 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 ELOVL5Q9NYP7 299 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa5.67□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 C2orf16Q68DN1 1984 aa5.67□□□□□ -1.5
TSPAN3-209ENST00000560715 A0A1W2PRS3 328 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms