RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 MXRA5Q9NR99 2828 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPYP01298 95 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 AMY2AP04746 511 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 IFNA6P05013 189 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGKV1-13P0DP09 117 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 EPHA1P21709 976 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 PAX6P26367 422 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 HTR1DP28221 377 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 AP3S2P59780 193 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 ODF3L1Q8IXM7 274 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 LYG1Q8N1E2 194 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR6F1Q8NGZ6 308 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 BEX2Q9BXY8 128 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 HRASLSQ9HDD0 168 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A0U1RQK1 487 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 LY6LH3BQJ8 138 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAB7AP51149 207 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 FXYD4P59646 89 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 MEF2DQ14814 521 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 DYNAPQ8N1N2 210 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARRDC1Q8N5I2 433 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 DPM3Q9P2X0 92 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 LUMP51884 338 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 BPIFB3P59826 476 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 IFITM3Q01628 133 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 MINOS1Q5TGZ0 78 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 CREB3L1Q96BA8 519 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR2D2Q9H210 308 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 MCUBQ9NWR8 336 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 HILPDAQ9Y5L2 63 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR5H14A6NHG9 310 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 LEUTXA8MZ59 168 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 DISC1C4P0D8 188 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 UPK1BO75841 260 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 HERV-K104P61576 105 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 SSX2Q16385 188 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 AADACL3Q5VUY0 350 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 C9orf139Q6ZV77 190 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM17Q86X19 198 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR51S1Q8NGJ8 323 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 SECTM1Q8WVN6 248 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 MOB3AQ96BX8 217 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 FXYD6Q9H0Q3 95 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAB29O14966 203 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLA2G10O15496 165 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 PROP1O75360 226 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAUP35544 74 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 GPR12P47775 334 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 REG1BP48304 166 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF137PP52743 207 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPL39P5Q59GN2 51 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 LHFPL1Q86WI0 220 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 TOMM40LQ969M1 308 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 MALSU1Q96EH3 234 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 C5orf30Q96GV9 206 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF251Q9BRH9 671 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 PIPOXQ9P0Z9 390 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF221Q9UK13 617 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSD17B6O14756 317 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 SRD5A1P18405 259 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 IL3RAP26951 378 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 CEACAM3P40198 252 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 DEFB112Q30KQ8 113 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 DEDD2Q8WXF8 326 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRGPRFQ96AM1 343 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPEQ96AT9 228 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC5A7Q9GZV3 580 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCL28Q9NRJ3 127 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 SDHAF2Q9NX18 166 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM96BQ9Y3D0 163 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZFHX3Q15911 3703 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGLV2-14P01704 120 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLA1AQ53H76 456 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF645Q8N7E2 425 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR13C8Q8NGS7 320 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-203ENST00000559737 TERB2Q8NHR7 220 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM216AQ8WUB2 273 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-203ENST00000559737 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-203ENST00000559737 GHITMQ9H3K2 345 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBC1D24Q9ULP9 559 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-203ENST00000559737 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-203ENST00000559737 DRAM1Q8N682 238 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-203ENST00000559737 BORCS5Q969J3 196 aa15.07■□□□□ 0
USP3-AS1-203ENST00000559737 S1PR3Q99500 378 aa15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms