RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558961.1

BMP4-204, Transcript of bone morphogenetic protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene BMP4, Length 495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4-204ENST00000558961 LOXL3P58215 753 aa8.99□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.99□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.99□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 Q3ZCU0 254 aa8.99□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.99□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 PHF21AQ96BD5 680 aa8.99□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 RAB3CQ96E17 227 aa8.99□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 CYYR1Q96J86 154 aa8.99□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 AKR1E2Q96JD6 320 aa8.99□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.99□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 PECRQ9BY49 303 aa8.99□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.99□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 A0A1W2PPI3 338 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 MCRIP1C9JLW8 97 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 H3BUI4 141 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 LYRM1O43325 122 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 OR2F2O95006 317 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 TSPAN15O95858 294 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 CD74P04233 296 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 GNB3P16520 340 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 ARL6IP1Q15041 203 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 ATAD3CQ5T2N8 411 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 Q6ZS46 218 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 Q6ZTK2 550 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 OR8H3Q8N146 312 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 LINC00311Q8N616 119 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 TOMM40LQ969M1 308 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 TMEM235A6NFC5 223 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 SERPINE3A8MV23 424 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 PDCD6O75340 191 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 RBBP9O75884 186 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 AMY1AP04745 511 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 AMY2AP04746 511 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 GSTT2BP0CG30 244 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 FUT3P21217 361 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 RAB7AP51149 207 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 ZNF137PP52743 207 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 BLCAPP62952 87 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 TRIM16LQ309B1 348 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 RFESDQ8TAC1 157 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 NEK7Q8TDX7 302 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 LEAP2Q969E1 77 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 ARL11Q969Q4 196 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 RPEQ96AT9 228 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 NEDD4LQ96PU5 975 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 HRASLSQ9HDD0 168 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 RAB9BQ9NP90 201 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 ETAA1Q9NY74 926 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.97□□□□□ -0.97
BMP4-204ENST00000558961 NAP1L6A6NFF2 107 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 C12orf77C9JDV5 145 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 M0QZK8 103 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 IGHV3-7P01780 117 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 CSF1P09603 554 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 VSIG10L2P0DP72 767 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 CD24P25063 80 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 RCVRNP35243 200 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 GNG10P50151 68 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 AP3S2P59780 193 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 ACTBP60709 375 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 C6orf183Q5T699 404 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 HOGA1Q86XE5 327 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.96□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 HSD17B6O14756 317 aa8.95□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 FBXO24O75426 580 aa8.95□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 HBZP02008 142 aa8.95□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 ZNF735P0CB33 412 aa8.95□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 TBPP20226 339 aa8.95□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 CBX5P45973 191 aa8.95□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 EBI3Q14213 229 aa8.95□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 LTC4SQ16873 150 aa8.95□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.95□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
BMP4-204ENST00000558961 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
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