RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 VEGFCP49767 419 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 EFNB2P52799 333 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 GABARAPL2P60520 117 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ACSM1Q08AH1 577 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 IL13RA2Q14627 380 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 MOGAT2Q3SYC2 334 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ABCA11PQ4W5N1 156 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 MIDNQ504T8 468 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 KRT74Q7RTS7 529 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 PRSS48Q7RTY5 328 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 MOB3BQ86TA1 216 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 SAXO1Q8IYX7 474 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 DRAM1Q8N682 238 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 PXT1Q8NFP0 134 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 OR4F5Q8NH21 305 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 LGALS14Q8TCE9 139 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 RPEQ96AT9 228 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 FAAP24Q9BTP7 215 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CST11Q9H112 138 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 DUSP21Q9H596 190 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 NDUFB11Q9NX14 153 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 AK3Q9UIJ7 227 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 PSG11Q9UQ72 335 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 TCF19Q9Y242 345 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 A0A1W2PPI3 338 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CLPSL1A2RUU4 121 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 FUOMA2VDF0 154 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 PGPEP1LA6NFU8 196 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 FAM90A7PA6NKC0 464 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 NPIPB5A8MRT5 1133 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 FAM90A22PA8MWA6 464 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 FAM90A12PA8MX19 464 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 TEX22C9J3V5 150 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 J3QR06 171 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CCRL2O00421 344 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 PDCD6O75340 191 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 GPX5O75715 221 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 IGKV1D-33P01593 117 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 IGKV1-33P01594 117 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 UCHL1P09936 223 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CD28P10747 220 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 PTHLHP12272 177 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ARSBP15848 533 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM11P17152 192 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 SRMP19623 302 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CPT2P23786 658 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CNTFRP26992 372 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CHATP28329 748 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 OR3A3P47888 321 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 BLCAPP62952 87 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 BDH1Q02338 343 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 MPV17LQ2QL34 196 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 OR2B11Q5JQS5 317 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 GLT8D1Q68CQ7 371 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ELP2Q6IA86 826 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 C11orf87Q6NUJ2 197 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF773Q6PK81 442 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 HEPN1Q6WQI6 88 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF497Q6ZNH5 498 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 NR2C2APQ86WQ0 139 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CHST4Q8NCG5 386 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 OR6M1Q8NGM8 313 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 OR9G1Q8NH87 305 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 LINC01006Q8NI28 216 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 NEDD4LQ96PU5 975 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 BARHL1Q9BZE3 327 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms