RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549055.1

AC023511.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC023511.1, Length 571 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC023511.1-201ENST00000549055 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 CCDC160A6NGH7 325 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 H3BMQ9 156 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 RAB27BO00194 218 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 TOR1AO14656 332 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 TMEM11P17152 192 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 CDK2P24941 298 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 TALDO1P37837 337 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 VEGFCP49767 419 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 CLDN12P56749 244 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 LGALS14Q8TCE9 139 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 DPM3Q9P2X0 92 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.3□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 A0A075B6Q4 140 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 A0A087X0M5 115 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 A0A1B0GX30 115 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 A0A1W2PPE3 182 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 LEUTXA8MZ59 168 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 XRCC3O43542 346 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 MT-ND4P03905 459 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 DTYMKP23919 212 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 MNDAP41218 407 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 GLP1RP43220 463 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 GNG10P50151 68 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 SLC35B1P78383 322 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 AESQ08117 197 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 KIR2DS1Q14954 304 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 STEAP3Q658P3 488 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 OR10K2Q6IF99 312 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 Q6ZS49 121 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 STPG2Q8N412 459 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 DRAM1Q8N682 238 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 OR8U1Q8NH10 309 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 CHPT1Q8WUD6 406 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 TOMM40LQ969M1 308 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 COQ2Q96H96 371 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 GHITMQ9H3K2 345 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 RETNQ9HD89 108 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.29□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 MFNGO00587 321 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 SOCS1O15524 211 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 SPINT2O43291 252 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 SAP30O75446 220 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 NAPSAO96009 420 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 IGKV1D-33P01593 117 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 IGKV1-33P01594 117 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 CD3GP09693 182 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 SPNP16150 400 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 CD34P28906 385 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 CBX5P45973 191 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 GLIPR1P48060 266 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 REG1BP48304 166 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 ARHGDIBP52566 201 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 TMEM50BP56557 158 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 HACD4Q5VWC8 232 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 OR11H1Q8NG94 326 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 ZNF596Q8TC21 504 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 CITED4Q96RK1 184 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 NICN1Q9BSH3 213 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 PECRQ9BY49 303 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 KIF25Q9UIL4 384 aa7.28□□□□□ -1.24
AC023511.1-201ENST00000549055 SORL1Q92673 2214 aa7.27□□□□□ -1.25
AC023511.1-201ENST00000549055 A0A0A6YYD4 124 aa7.27□□□□□ -1.25
AC023511.1-201ENST00000549055 SMIM30A4D0T7 59 aa7.27□□□□□ -1.25
AC023511.1-201ENST00000549055 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
AC023511.1-201ENST00000549055 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms