RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 HTR1FP30939 366 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 CD200P41217 278 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 CDNFQ49AH0 187 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 TMEM104Q8NE00 496 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 RFKQ969G6 155 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 A0A0G2JK05 382 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 OR2T7P0C7T2 308 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 CD28P10747 220 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 MGMTP16455 207 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 ATP1B3P54709 279 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 AP3S2P59780 193 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 TRAM1Q15629 374 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 AWAT2Q6E213 333 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 LIN54Q6MZP7 749 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 ARL11Q969Q4 196 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 CHST1O43916 411 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 ZNF728P0DKX0 622 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 PTHLHP12272 177 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 SMCO1Q147U7 214 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 CHST4Q8NCG5 386 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 C1RLQ9NZP8 487 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 HSPA12AO43301 675 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 WIPF1O43516 503 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 LY86O95711 162 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 IGF2P01344 180 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 OPN1MWP04001 364 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 STUMQ69YW2 141 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 GID4Q8IVV7 300 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 THAP6Q8TBB0 222 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 CMTM3Q96MX0 182 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 MS4A10Q96PG2 267 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 S4R3C0 116 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 IGHV3-11P01762 117 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 OR3A1P47881 315 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 ZNF649Q9BS31 505 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 MFFQ9GZY8 342 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 COL7A1Q02388 2944 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 A0A0D9SG52 128 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 J3QT63 122 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 CD55P08174 381 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 MNDAP41218 407 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 FOXL1Q12952 345 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 ZNF714Q96N38 554 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 NOX4Q9NPH5 578 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CS-212ENST00000548567 SPDEFO95238 335 aa6.1□□□□□ -1.43
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