RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 C4BPBP20851 252 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 GNLYP22749 145 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 GCH1P30793 250 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 GLRXP35754 106 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 PIGPP57054 158 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 FXYD4P59646 89 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 RND3P61587 244 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 CYCSP99999 105 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 OR2F1Q13607 317 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 SP6Q3SY56 376 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 SPRNQ5BIV9 151 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 BEX5Q5H9J7 111 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 CLLU1Q5K131 121 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 GGNBP1Q5YKI7 109 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 WDR82Q6UXN9 313 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 ACP7Q6ZNF0 438 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 ZNF497Q6ZNH5 498 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 SGPP2Q8IWX5 399 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 Q8IYB0 196 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 C1orf174Q8IYL3 243 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 SLC38A6Q8IZM9 456 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 LRTM2Q8N967 370 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 SPERTQ8NA61 448 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 LHFPL5Q8TAF8 219 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 THAP6Q8TBB0 222 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 GLYATL2Q8WU03 294 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 TOMM40LQ969M1 308 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 CABLES2Q9BTV7 478 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 ARL6Q9H0F7 186 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 PIGMQ9H3S5 423 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 TMEM165Q9HC07 324 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 CCL28Q9NRJ3 127 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 C1orf123Q9NWV4 160 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 TREM2Q9NZC2 230 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 COMMD9Q9P000 198 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 UBQLN2Q9UHD9 624 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 RTTNQ86VV8 2226 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 CACNA1BQ00975 2339 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 TUBAL3A6NHL2 446 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 USP17L23D6RBM5 183 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 F5H0A9 414 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 BET1O15155 118 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 NXPH2O95156 264 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 DIRAS3O95661 229 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 HAND1O96004 215 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 IFNA7P01567 189 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 IGHV3-13P01766 116 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 TFF1P04155 84 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 CFHR2P36980 270 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 CD200P41217 278 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 GLP1RP43220 463 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 KIR2DS4P43632 304 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 HLA-DRB3P79483 266 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 HNF4GQ14541 408 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 KIR2DS1Q14954 304 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 HMGN3Q15651 99 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 PHLDA2Q53GA4 152 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 SPIN3Q5JUX0 258 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 PRSS54Q6PEW0 395 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 GFRALQ6UXV0 394 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 LYZL2Q7Z4W2 148 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 SLC51BQ86UW2 128 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 OR8H3Q8N146 312 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 CD177Q8N6Q3 437 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 OR4A4PQ8NGN8 299 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 NEK7Q8TDX7 302 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 ERGIC1Q969X5 290 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 TP53RKQ96S44 253 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 SUCNR1Q9BXA5 334 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 SLC2A9Q9NRM0 540 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 UFSP2Q9NUQ7 469 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 ASF1BQ9NVP2 202 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 OR5AC2Q9NZP5 309 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 MBD2Q9UBB5 411 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 MAB21L2Q9Y586 359 aa4.49□□□□□ -1.69
TRDN-205ENST00000546248 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.6 ms