RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540240.1

C16orf62-212, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 633 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-212ENST00000540240 A0A1W2PN81 502 aa5.89□□□□□ -1.47
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C16orf62-212ENST00000540240 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa5.88□□□□□ -1.47
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C16orf62-212ENST00000540240 GALMQ96C23 342 aa5.87□□□□□ -1.47
C16orf62-212ENST00000540240 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
C16orf62-212ENST00000540240 TUBA4BQ9H853 241 aa5.87□□□□□ -1.47
C16orf62-212ENST00000540240 TAF9BQ9HBM6 251 aa5.87□□□□□ -1.47
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF581Q9P0T4 197 aa5.87□□□□□ -1.47
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C16orf62-212ENST00000540240 CKLFQ9UBR5 152 aa5.87□□□□□ -1.47
C16orf62-212ENST00000540240 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
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