RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	MND1	Q9BWT6	205 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	NEK6	Q9HC98	313 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	STUB1	Q9UNE7	303 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	C12orf77	C9JDV5	145 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198		E9PI62	339 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198		J3QRK9	145 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	FCN1	O00602	326 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	SULT1B1	O43704	296 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	LANCL1	O43813	399 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	JTB	O76095	146 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	OR8U9	P0C7N5	309 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	CPE	P16870	476 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	RYR1	P21817	5038 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	RANBP1	P43487	201 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ACTB	P60709	375 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	SPHAR	Q15513	63 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	SSX1	Q16384	188 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIM16L	Q309B1	348 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	STEAP3	Q658P3	488 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	LIN54	Q6MZP7	749 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	GAPT	Q8N292	157 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	GHITM	Q9H3K2	345 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	AASS	Q9UDR5	926 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	MAGEB3	O15480	346 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	TXNL1	O43396	289 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	NDUFA3	O95167	84 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	CDRT1	O95170	752 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	HTR3B	O95264	441 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	IL3RA	P26951	378 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	S100A5	P33763	92 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ATP6V1E1	P36543	226 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	MMD	Q15546	238 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	MORN2	Q502X0	79 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	OR1L1	Q8NH94	360 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	OR4C12	Q96R67	309 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	RETN	Q9HD89	108 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	PARP11	Q9NR21	331 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198		A0A1W2PP11	408 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198		J3QLW9	94 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	NBR2	O15453	112 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	GPX5	O75715	221 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	IGHV3-11	P01762	117 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ARSB	P15848	533 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF19	P17023	458 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	CX3CL1	P78423	397 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	OR52N1	Q8NH53	320 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	RFK	Q969G6	155 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	C4orf36	Q96KX1	117 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	CENPO	Q9BU64	300 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	OR51E2	Q9H255	320 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	IL36G	Q9NZH8	169 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198		A0A1W2PN81	502 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	DAPL1	A0PJW8	107 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	HBZ	P02008	142 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	IFNA6	P05013	189 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM4B-208	ENST00000534198	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		6.6	□□□□□ -1.35

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