RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AUNIPQ9H7T9 357 aa13.16□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MDKP21741 143 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CD1BP29016 333 aa13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CEACAM6P40199 344 aa13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CBX5P45973 191 aa13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EBI3Q14213 229 aa13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM219Q86XT9 240 aa13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C3orf56Q8N813 242 aa13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 S1PR3Q99500 378 aa13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AGMATQ9BSE5 352 aa13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC25A33Q9BSK2 321 aa13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR1A1Q9P1Q5 309 aa13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MOB4Q9Y3A3 225 aa13.15□□□□□ -0.3
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TENM1Q9UKZ4 2725 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SSX5O60225 188 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GSTT2P0CG29 244 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GSTT2BP0CG30 244 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C5orf24Q7Z6I8 188 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MOB3BQ86TA1 216 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR2T6Q8NHC8 308 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LINC01006Q8NI28 216 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF747Q9BV97 191 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RDH8Q9NYR8 311 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COMMD3Q9UBI1 195 aa13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FGF16O43320 207 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TPPPO94811 219 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGKV1D-33P01593 117 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGKV1-33P01594 117 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM11P17152 192 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 REG1BP48304 166 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TAS2R20P59543 309 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LSAMPQ13449 338 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LINC01559Q495D7 138 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CNIH2Q6PI25 160 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR8H1Q8NGG4 311 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR2T10Q8NGZ9 312 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ISOC1Q96CN7 298 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GINS4Q9BRT9 223 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRSS22Q9GZN4 317 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANXA10Q9UJ72 324 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RNF114Q9Y508 228 aa13.13□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR5H14A6NHG9 310 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 H3BMQ9 156 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BET1O15155 118 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PROK1P58294 105 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HES1Q14469 280 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPCS2Q15005 226 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGSF11Q5DX21 431 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SHISA2Q6UWI4 295 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HOGA1Q86XE5 327 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 Q8N6K4 173 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAFIPQ8WZ33 124 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF702PQ9H963 129 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF221Q9UK13 617 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADAM30Q9UKF2 790 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GAB2Q9UQC2 676 aa13.12□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MOSP00540 346 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CD24P25063 80 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BEST4Q8NFU0 473 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C15orf40Q8WUR7 153 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NABP2Q9BQ15 211 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF251Q9BRH9 671 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SCPEP1Q9HB40 452 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANAPC10Q9UM13 185 aa13.11□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HPGDSO60760 199 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ELK1P19419 428 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GPR12P47775 334 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR3A3P47888 321 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARPC4P59998 168 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CEPT1Q9Y6K0 416 aa13.1□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SULT1C2O00338 296 aa13.09□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC22A5O76082 557 aa13.09□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MC5RP33032 325 aa13.09□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRSS3P35030 304 aa13.09□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FBLN7Q53RD9 439 aa13.09□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C5orf56Q8N8D9 126 aa13.09□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABHD14BQ96IU4 210 aa13.09□□□□□ -0.31
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms