RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	TRDC	B7Z8K6	153 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	HSPA12A	O43301	675 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	TFAP2A	P05549	437 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	FAM106CP	P0CH98	169 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	ZBTB25	P24278	435 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF134	P52741	427 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	PITPNA	Q00169	270 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	DRAM1	Q8N682	238 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	FABP7	O15540	132 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	OR2F2	O95006	317 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	DIRAS3	O95661	229 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	SCT	P09683	121 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	DTYMK	P23919	212 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	REG1B	P48304	166 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	CTF1	Q16619	201 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	CDNF	Q49AH0	187 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	GPR107	Q5VW38	600 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	HACD4	Q5VWC8	232 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM235	A6NFC5	223 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148		K7EIL1	84 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	ITGB1BP1	O14713	200 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	LANCL1	O43813	399 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	AMY1A	P04745	511 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	AMY2A	P04746	511 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	GNG2	P59768	71 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	HES1	Q14469	280 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148		Q6ZS49	121 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	MOB3B	Q86TA1	216 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	DIABLO	Q9NR28	239 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	COL7A1	Q02388	2944 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148		M0QZK8	103 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	PEX14	O75381	377 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	IGKV1D-33	P01593	117 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	IGKV1-33	P01594	117 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM11	P17152	192 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	CEACAM6	P40199	344 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	ABCG5	Q9H222	651 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	GHITM	Q9H3K2	345 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	RAB29	O14966	203 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	ST8SIA5	O15466	376 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	CD33	P20138	364 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	GSTT2	P0CG29	244 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	GSTT2B	P0CG30	244 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	CD1B	P29016	333 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	RORC	P51449	518 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP10-11	P60412	298 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	AP3S1	Q92572	193 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	S1PR3	Q99500	378 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		13.15	□□□□□ -0.3
MIB2-223	ENST00000508148	RDH8	Q9NYR8	311 aa		13.15	□□□□□ -0.3

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