RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495522.1

CALD1-222, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CALD1, Length 2,199 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-222	ENST00000495522	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	IFNL4	K9M1U5	179 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	RAB2A	P61019	212 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	RHEB	Q15382	184 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	FGFRL1	Q8N441	504 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	NINJ1	Q92982	152 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	TAAR6	Q96RI8	345 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	OR2D2	Q9H210	308 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	DKK4	Q9UBT3	224 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	CGA	P01215	116 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	HBE1	P02100	147 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	FOLR2	P14207	255 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	GABRA2	P47869	451 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	HBG1	P69891	147 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	HBG2	P69892	147 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	MZT1	Q08AG7	82 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	TUBA4B	Q9H853	241 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	RNF150	Q9ULK6	438 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	OR5H1	A6NKK0	313 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	IGHV2-70	P01814	119 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	SFTPC	P11686	197 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	MSMO1	Q15800	293 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522		A0A1B0GWJ7	208 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	COL10A1	Q03692	680 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	CATR1	Q13166	79 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF525	Q8N782	197 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	FBP1	P09467	338 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	C5orf30	Q96GV9	206 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	LURAP1	Q96LR2	239 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	MT-ND4L	P03901	98 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	TFF1	P04155	84 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	UBE2K	P61086	200 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	ARL16	Q0P5N6	197 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	HAGH	Q16775	308 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	LRRC29	Q8WV35	223 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	METRN	Q9UJH8	293 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	GTF3C1	Q12789	2109 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	RAMP3	O60896	148 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	OR8U8	P0C7N1	319 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	GLIPR1	P48060	266 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	TNFRSF9	Q07011	255 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	ICAM4	Q14773	271 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522		P0C879	139 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	RAB5B	P61020	215 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	RNF212	Q495C1	297 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	RSG1	Q9BU20	258 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CALD1-222	ENST00000495522	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35

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