RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 OR4A8P0C604 315 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 OR1E2P47887 323 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 BSPH1Q075Z2 132 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 SPIN4Q56A73 249 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 SCXQ7RTU7 201 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 ACY3Q96HD9 319 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD14BQ96IU4 210 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 MROQ9BYG7 248 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 MED28Q9H204 178 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 OR51B6Q9H340 312 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 ALG5Q9Y673 324 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 CFTRP13569 1480 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 E7EQL1 145 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 BIRC5O15392 142 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 COCHO43405 550 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 OR13C7P0DN81 318 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 MIPP30301 263 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 ACTBP60709 375 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 ACTG1P63261 375 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35A2P78381 396 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 DEFA6Q01524 100 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 PDGFRLQ15198 375 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 SLC36A2Q495M3 483 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 MFSD8Q8NHS3 518 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 SUN5Q8TC36 379 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 OR51B4Q9Y5P0 310 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 ATAD5Q96QE3 1844 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 CPS1P31327 1500 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 GRIN2BQ13224 1484 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 NPATQ14207 1427 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PNM2 257 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00862A6NCI5 91 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 OCM2P0CE71 109 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 UGT2B7P16662 529 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 CDK2P24941 298 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 ACSBG2Q5FVE4 666 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 OR10P1Q8NGE3 313 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 GPR119Q8TDV5 335 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 USE1Q9NZ43 259 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 CUL7Q14999 1698 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 AZIN1O14977 448 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 SSNA1O43805 119 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 PSMG1O95456 288 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 IFNGR2P38484 337 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 SMARCD3Q6STE5 483 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 DEFB132Q7Z7B7 95 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 Q8N402 240 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 OR10D3Q8NH80 312 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 LMX1AQ8TE12 382 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 SLC37A2Q8TED4 501 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 ASB13Q8WXK3 278 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 KCTD7Q96MP8 289 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 GNB1LQ9BYB4 327 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF407Q9C0G0 2248 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 IGSF23A1L1A6 192 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 F5H768 121 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV3-27P01718 113 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 APOEP02649 317 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 CTSGP08311 255 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 NQO1P15559 274 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V0CP27449 155 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 OPRM1P35372 400 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEA2P43356 314 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 GZMMP51124 257 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 TNFRSF9Q07011 255 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 MESTQ5EB52 335 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 LCN8Q6JVE9 175 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 ERMNQ8TAM6 284 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 DDI1Q8WTU0 396 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 TIPINQ9BVW5 301 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PP64 1363 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 BCL9LQ86UU0 1499 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 MROH2BQ7Z745 1585 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 G3V3Q6 166 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 DEDDO75618 318 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 COILP38432 576 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 EBPQ15125 230 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC112Q8NEF3 446 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 ABCC8Q09428 1581 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 DNMBPQ6XZF7 1577 aa3.7□□□□□ -1.82
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