RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	MMP26	Q9NRE1	261 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZAN	Q9Y493	2812 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ISPD	A4D126	451 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5H14	A6NHG9	310 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC31A2	O15432	143 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	FABP7	O15540	132 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	LYRM1	O43325	122 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB3D	O95716	219 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-7	P01780	117 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	HBZ	P02008	142 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	HEXA	P06865	529 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	OMG	P23515	440 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC6A1	P30531	599 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNJ3	P48549	501 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDLIM4	P50479	330 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	HLA-DRB3	P79483	266 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEK7	Q8TDX7	302 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CORO2A	Q92828	525 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB1C	Q92928	201 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	LEAP2	Q969E1	77 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHF21A	Q96BD5	680 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	MED30	Q96HR3	178 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	MMP28	Q9H239	520 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	PALMD	Q9NP74	551 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		5	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	AADAC	P22760	399 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLP1R	P43220	463 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	EDDM3B	P56851	147 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00205	P59089	165 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDK10	Q15131	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	POC5	Q8NA72	575 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM230	Q96A57	120 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61

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