RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489333.1

GABRE-210, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit, humanhuman

TSL 2

Gene GABRE, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRE-210ENST00000489333 DYRK2Q92630 601 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 NINJ1Q92982 152 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 GALMQ96C23 342 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 C12orf57Q99622 126 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SSX3Q99909 188 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 FAM166BA8MTA8 275 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 AP4M1O00189 453 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SYNGR1O43759 233 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 LILRA1O75019 489 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 NXPH2O95156 264 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 IL18BPO95998 194 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 IGHV3-9P01782 118 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 IGHG3P01860 377 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 CBR1P16152 277 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 NFYBP25208 207 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 UBE2KP61086 200 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ZNF766Q5HY98 468 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 DNLZQ5SXM8 178 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 Q6ZPA2 131 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 Q6ZT83 130 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 OR51H1Q8NH63 302 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 GPR146Q96CH1 333 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 LURAP1Q96LR2 239 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 TAAR6Q96RI8 345 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 CLCC1Q96S66 551 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 HES4Q9HCC6 221 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 PSENENQ9NZ42 101 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 VAX2Q9UIW0 290 aa7.3□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 C9JQL5 133 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 H3BQ15 152 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 HS3ST1O14792 307 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SMPD2O60906 423 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 MPDU1O75352 247 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 CEACAM4O75871 244 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 OR2H2O95918 312 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 NGFP01138 241 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ADH4P08319 380 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 CA6P23280 308 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 WNT5AP41221 380 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ARG2P78540 354 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SSX2Q16385 188 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ZNF429Q86V71 674 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 MDP1Q86V88 176 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 LILRB2Q8N423 598 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 Q8NA96 180 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 NAXEQ8NCW5 288 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 RDH5Q92781 318 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SARAFQ96BY9 339 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 AGMATQ9BSE5 352 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 MANBALQ9NQG1 85 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.29□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 TMEM250H0YL14 139 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 AQP7O14520 342 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 RAB29O14966 203 aa7.28□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms