RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484412.1

HDLBP-240, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-240	ENST00000484412	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	S1PR3	Q99500	378 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	NABP2	Q9BQ15	211 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	SCOC	Q9UIL1	159 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	RNF114	Q9Y508	228 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-240	ENST00000484412	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	SULT1C2	O00338	296 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	GNG2	P59768	71 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	IGSF11	Q5DX21	431 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	LYG1	Q8N1E2	194 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	C3orf56	Q8N813	242 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	RDH8	Q9NYR8	311 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412		A0A075B6Q4	140 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	TMEM235	A6NFC5	223 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	HSPA12A	O43301	675 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	SLC22A5	O76082	557 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	MOS	P00540	346 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	BLCAP	P62952	87 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	MSMO1	Q15800	293 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	CITED1	Q99966	193 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	ZNF702P	Q9H963	129 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	TUSC2	O75896	110 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	CT45A6	P0DMU7	189 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	CT45A5	P0DMU8	189 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	CT45A7	P0DMV0	189 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	SOX6	P35712	828 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	MOB3B	Q86TA1	216 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	BEST4	Q8NFU0	473 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	OR56B4	Q8NH76	319 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	ZNF580	Q9UK33	172 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	RBBP9	O75884	186 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	IGKV1-33	P01594	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	IGHG2	P01859	326 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	ELK1	P19419	428 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	CD24	P25063	80 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	PRSS3	P35030	304 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	TAS2R20	P59543	309 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	LSAMP	Q13449	338 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	SPCS2	Q15005	226 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	NPB	Q8NG41	125 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	GPX8	Q8TED1	209 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	ZNF221	Q9UK13	617 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	STAB1	Q9NY15	2570 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	ST8SIA5	O15466	376 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	TMEM11	P17152	192 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-240	ENST00000484412	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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