RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4S2Q8NH73 311 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 MUC7Q8TAX7 377 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 MCOLN3Q8TDD5 553 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM239Q8WW34 195 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 GTF2H4Q92759 462 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RCN3Q96D15 328 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 MCEEQ96PE7 176 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SUCNR1Q9BXA5 334 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 DIABLOQ9NR28 239 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PSG8Q9UQ74 426 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 GJE1A6NN92 205 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM25AB3EWG3 89 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM25CB3EWG5 89 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM25GB3EWG6 89 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 K7EIL1 84 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 MYO1DO94832 1006 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 MLNP12872 115 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB3BP20337 219 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 KDELR1P24390 212 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 CEACAM6P40199 344 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 MYCNOSP40205 109 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 CTRLP40313 264 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 MAGEA6P43360 314 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PPICP45877 212 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 HCAR3P49019 387 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RPL14P50914 215 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 AP1S2P56377 157 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 GNG2P59768 71 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 UBE2KP61086 200 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 MAXP61244 160 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PSME3P61289 254 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP1CBP62140 327 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 CACNG7P62955 275 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PDK2Q15119 407 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PSG5Q15238 335 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 QPRTQ15274 297 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 POU2AF1Q16633 256 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF773Q6PK81 442 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 GTSCR1Q86UQ5 136 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 DHFR2Q86XF0 187 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 C10orf107Q8IVU9 208 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 GRPEL2Q8TAA5 225 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 CYGBQ8WWM9 190 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 LYSMD1Q96S90 227 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 CIB1Q99828 191 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 C20orf27Q9GZN8 174 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 DOCK11Q5JSL3 2073 aa3.89□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 BBIP1A8MTZ0 92 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SMLR1H3BR10 107 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 hCG_2039718K7EN88 272 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PHOX2AO14813 284 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 CTNSO60931 367 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PIAS1O75925 651 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RCBTB2O95199 551 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 IGLV2-23P01705 113 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 C1QAP02745 245 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 FABP3P05413 133 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ERGP11308 486 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 M6PRP20645 277 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PRTN3P24158 256 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 DNASE1L1P49184 302 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 TAS2R60P59551 318 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 DEFA1P59665 94 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 DEFA3P59666 94 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 OR2B8PP59922 312 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 GABARAPL2P60520 117 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SKP1P63208 163 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 BNIP2Q12982 314 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PRPSAP1Q14558 356 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RGNQ15493 299 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 NEDD8Q15843 81 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SMUG1Q53HV7 270 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF691Q5VV52 312 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 STEAP4Q687X5 459 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 OR2T5Q6IEZ7 315 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PLET1Q6UQ28 207 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP4Z1Q86W10 505 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM156Q8N614 296 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC54Q8NEL0 328 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 OR2T29Q8NH02 315 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM234Q8WY98 164 aa3.88□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms