RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 BANF2Q9H503 90 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 PARP11Q9NR21 331 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 ETAA1Q9NY74 926 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 KIAA1456Q9P272 454 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 TNCP24821 2201 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 SLC22A1O15245 554 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 PROP1O75360 226 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 SC5DO75845 299 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 NDUFA3O95167 84 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 PSMB9P28065 219 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 RAB40BQ12829 278 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 RAB12Q6IQ22 244 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 ACSM6Q6P461 480 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.33□□□□□ -1.08
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NISCH-206ENST00000474188 ZNF429Q86V71 674 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 NPBQ8NG41 125 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 CITED4Q96RK1 184 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 FBXL15Q9H469 300 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 GNG12Q9UBI6 72 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 IRGMA1A4Y4 181 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 UBE2QL1A1L167 161 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 SAP30O75446 220 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 IGHV3-11P01762 117 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 LYL1P12980 280 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 CD36P16671 472 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 IL3RAP26951 378 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 INSL3P51460 131 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 ECSCRQ19T08 205 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 LINC00596Q86U02 117 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 NEK7Q8TDX7 302 aa8.32□□□□□ -1.08
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NISCH-206ENST00000474188 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 A0A1W2PN81 502 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 SNTNA6NMZ2 147 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 NBR2O15453 112 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 MAGEB3O15480 346 aa8.31□□□□□ -1.08
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NISCH-206ENST00000474188 CT45A6P0DMU7 189 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 CT45A5P0DMU8 189 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 CT45A7P0DMV0 189 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 GTF2F2P13984 249 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 CHRNA7P36544 502 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 CX3CL1P78423 397 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 INSL4Q14641 139 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 SSX1Q16384 188 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
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NISCH-206ENST00000474188 OR10K2Q6IF99 312 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 LIN54Q6MZP7 749 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 RHOVQ96L33 236 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 Q96M66 194 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 OR14A2Q96R54 314 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 MGLLQ99685 303 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 A3GALT2U3KPV4 340 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 A0A0A6YYD4 124 aa8.3□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 MCRIP1C9JLW8 97 aa8.3□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 LINC01619G3V211 115 aa8.3□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 ST8SIA5O15466 376 aa8.3□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 SPINT2O43291 252 aa8.3□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 TXNL1O43396 289 aa8.3□□□□□ -1.08
NISCH-206ENST00000474188 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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