RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466764.5

RBM3-204, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 3

Gene RBM3, Length 1,375 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-204	ENST00000466764	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM3-204	ENST00000466764	LAX1	Q8IWV1	398 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM3-204	ENST00000466764	OR8H3	Q8N146	312 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM3-204	ENST00000466764	CMTM3	Q96MX0	182 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM3-204	ENST00000466764	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM3-204	ENST00000466764	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM3-204	ENST00000466764	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM3-204	ENST00000466764	RGS5	O15539	181 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	HES1	Q14469	280 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	HNF4G	Q14541	408 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	SNAPC3	Q92966	411 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	GINS4	Q9BRT9	223 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764		J3QRK9	145 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	LANCL1	O43813	399 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	IGKV1D-33	P01593	117 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	IGKV1-33	P01594	117 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	ITGB1BP1	O14713	200 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	NDUFA7	O95182	113 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	C5orf30	Q96GV9	206 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	NABP2	Q9BQ15	211 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	IFT46	Q9NQC8	304 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	RAB29	O14966	203 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	TXNL1	O43396	289 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	PROP1	O75360	226 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	DIRAS3	O95661	229 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	TMEM11	P17152	192 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	PRSS3	P35030	304 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	ARPC4	P59998	168 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	FOXL1	Q12952	345 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	LSAMP	Q13449	338 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764		Q6ZS46	218 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	OR4F5	Q8NH21	305 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	OR2D2	Q9H210	308 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	OR2F2	O95006	317 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	LPL	P06858	475 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	FAM106CP	P0CH98	169 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	CBX5	P45973	191 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	GPR12	P47775	334 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	LINC00205	P59089	165 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	GPX8	Q8TED1	209 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	ZNF702P	Q9H963	129 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	ZNF221	Q9UK13	617 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	DPPA5	A6NC42	116 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	TSPAN9	O75954	239 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	BLCAP	P62952	87 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	MCFD2	Q8NI22	146 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	S1PR3	Q99500	378 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	ANK2	Q01484	3957 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764		M0R1X1	148 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	AMY1A	P04745	511 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	AMY2A	P04746	511 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	CT45A6	P0DMU7	189 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	CT45A5	P0DMU8	189 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	CT45A7	P0DMV0	189 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM3-204	ENST00000466764	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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