RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 OR3A3P47888 321 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 RFX2P48378 723 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF137PP52743 207 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 LGALS4P56470 323 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 TAS2R19P59542 299 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 LSAMPQ13449 338 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 BAK1Q16611 211 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 VAX1Q5SQQ9 334 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 ODF3L1Q8IXM7 274 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 OR4D10Q8NGI6 311 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 AGMATQ9BSE5 352 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 DPM3Q9P2X0 92 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 HIVEP2P31629 2446 aa8.29□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 LEUTXA8MZ59 168 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 RAB3DO95716 219 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 IL7P13232 177 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 PAX6P26367 422 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 FCGR2CP31995 323 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 CEACAM3P40198 252 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 RAB7AP51149 207 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 PPP5CP53041 499 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF846Q147U1 533 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 DEFB112Q30KQ8 113 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 LYG1Q8N1E2 194 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 OR4C16Q8NGL9 310 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 CREB3L1Q96BA8 519 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 MALSU1Q96EH3 234 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 ABHD14BQ96IU4 210 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 SLC6A7Q99884 636 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 RNF150Q9ULK6 438 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 J3QRK9 145 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 HSD17B6O14756 317 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 PROP1O75360 226 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 PPYP01298 95 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 OR8U9P0C7N5 309 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF735P0CB33 412 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 FAM157CP0CG43 387 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 AKAIN1P0CW23 69 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 CD40LGP29965 261 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 MEF2DQ14814 521 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 SSX2Q16385 188 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 FAAP20Q6NZ36 180 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 OR8U1Q8NH10 309 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 TOMM40LQ969M1 308 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 CCDC32Q9BV29 185 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.27□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1W2PPI3 338 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 OOSP1A8MZH6 123 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 RAB29O14966 203 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 FBXO24O75426 580 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV2-14P01704 120 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 FBP1P09467 338 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 IL3RAP26951 378 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 GPR12P47775 334 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 FXYD4P59646 89 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 SCGB2A2Q13296 93 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 TRIQKQ629K1 86 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.26□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 OR56B4Q8NH76 319 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms