RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 VCXQ9H320 206 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 GHITMQ9H3K2 345 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 C8orf4Q9NR00 106 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 SCN3BQ9NY72 215 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC01619G3V211 115 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 RAB29O14966 203 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 HLA-DRB1P01911 266 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 CPEP16870 476 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 CHATP28329 748 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 SLURP1P55000 103 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 P2RY14Q15391 338 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF221Q9UK13 617 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 I3L521 148 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 FCN1O00602 326 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 RRHO14718 337 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 SOCS1O15524 211 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 CNIH1O95406 144 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 IGLV1-40P01703 118 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 CD1AP06126 327 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 CDK1P06493 297 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 CT45A6P0DMU7 189 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 CT45A5P0DMU8 189 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 CT45A7P0DMV0 189 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 ARSBP15848 533 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 ZBTB25P24278 435 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 MC5RP33032 325 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 VEGFCP49767 419 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 INSL3P51460 131 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 TPPP2P59282 170 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 CX3CL1P78423 397 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 SPHARQ15513 63 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 HMGN3Q15651 99 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 ACTBL2Q562R1 376 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF429Q86V71 674 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 SVOPQ8N4V2 548 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 LFNGQ8NES3 379 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 NPBQ8NG41 125 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 OR4C12Q96R67 309 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 AK3Q9UIJ7 227 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A075B6Q4 140 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A087WW49 117 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 OR5H14A6NHG9 310 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 BPNT1O95861 308 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TRGV3P03979 118 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 SCTP09683 121 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 SPNP16150 400 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 PITPNAQ00169 270 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 UNC119Q13432 240 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 FHL3Q13643 280 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 LYPD6Q86Y78 171 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 OR5T1Q8NG75 326 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 PHYHIPQ92561 330 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ARPC1AQ92747 370 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 UFD1Q92890 307 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms