RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FABP7O15540 132 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEACAM6P40199 344 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IDNKQ5T6J7 187 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NABP2Q9BQ15 211 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB29O14966 203 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 XRCC3O43542 346 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SSX5O60225 188 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV1D-33P01593 117 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV1-33P01594 117 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LPLP06858 475 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GSTT2P0CG29 244 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GSTT2BP0CG30 244 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NCS1P62166 190 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LSAMPQ13449 338 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LYG1Q8N1E2 194 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AUNIPQ9H7T9 357 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF580Q9UK33 172 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WIPF1O43516 503 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MOSP00540 346 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CTXN2P0C2S0 81 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CT45A6P0DMU7 189 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CT45A5P0DMU8 189 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CT45A7P0DMV0 189 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR3A3P47888 321 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 REG1BP48304 166 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VBP1P61758 197 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARFRP1Q13795 201 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MOB3BQ86TA1 216 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SETD6Q8TBK2 473 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNF5Q99942 180 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DIABLOQ9NR28 239 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RDH8Q9NYR8 311 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM235A6NFC5 223 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TPPPO94811 219 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHG2P01859 326 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 APOA1P02647 267 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM11P17152 192 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MC5RP33032 325 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TALDO1P37837 337 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ABCA11PQ4W5N1 156 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGSF11Q5DX21 431 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPR107Q5VW38 600 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CNIH2Q6PI25 160 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q8N9W7 124 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NPBQ8NG41 125 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 S1PR3Q99500 378 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A075B6Q4 140 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR5H14A6NHG9 310 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSPA12AO43301 675 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TUSC2O75896 110 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HLA-DQB1P01920 261 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RORCP51449 518 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMBIM6P55061 237 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 F2RL1P55085 397 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBE2NLQ5JXB2 153 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPR141Q7Z602 305 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HOGA1Q86XE5 327 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms