RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PTPA-222	ENST00000445241	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PTPA-222	ENST00000445241	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PTPA-222	ENST00000445241	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PTPA-222	ENST00000445241	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PTPA-222	ENST00000445241	GAB2	Q9UQC2	676 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PTPA-222	ENST00000445241	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PTPA-222	ENST00000445241	RNF114	Q9Y508	228 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PTPA-222	ENST00000445241	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	GSTT2	P0CG29	244 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	GSTT2B	P0CG30	244 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	PROK1	P58294	105 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	CNIH2	Q6PI25	160 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	MOB3B	Q86TA1	216 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	RDH8	Q9NYR8	311 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	SSX5	O60225	188 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	MOS	P00540	346 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV1-33	P01594	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM11	P17152	192 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	LSAMP	Q13449	338 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	IGSF11	Q5DX21	431 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	HOGA1	Q86XE5	327 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	GINS4	Q9BRT9	223 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF702P	Q9H963	129 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF221	Q9UK13	617 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	BET1	O15155	118 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ST8SIA5	O15466	376 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	SLC22A5	O76082	557 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	CD24	P25063	80 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	MC5R	P33032	325 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	REG1B	P48304	166 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	TAS2R20	P59543	309 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	HES1	Q14469	280 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241		Q8N6K4	173 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	NABP2	Q9BQ15	211 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241		H3BMQ9	156 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	GPR12	P47775	334 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	SPCS2	Q15005	226 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	BEST4	Q8NFU0	473 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	SULT1C2	O00338	296 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	RBBP9	O75884	186 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS3	P35030	304 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	OR3A3	P47888	321 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	RNF5	Q99942	180 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	CITED1	Q99966	193 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	HPGDS	O60760	199 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	HLA-DQB1	P01920	261 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	AMY1A	P04745	511 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	AMY2A	P04746	511 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	NAT1	P18440	290 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ELK1	P19419	428 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	ARPC4	P59998	168 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	BLCAP	P62952	87 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	MSMO1	Q15800	293 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	IFT46	Q9NQC8	304 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	BATF3	Q9NR55	127 aa		11.65	□□□□□ -0.54

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